Qu’est-ce que la botanique algorithmique ?

Discipline consacrée à l’utilisation de moyens virtuels pour enrichir la banque de connaissances sur les plantes et la vie végétale, la botanique algorithmique fournit au botaniste l’utilisation d’outils informatiques pour étudier et simuler différents scénarios concernant les plantes. Cette utilisation d’outils virtuels pour étudier les plantes virtuelles a déjà reçu beaucoup d’attention et fait l’objet d’un important programme d’études à l’Université de Calgary.

Le processus de la botanique algorithmique est mieux exprimé en tant que modélisation et visualisation biologiques, plus communément appelée approche BMV. C’est cette approche qui constitue la base de la recherche qui est actuellement menée sous les auspices du département d’informatique de l’Université de Calgary. Essentiellement, les modèles de botanique algorithmique sont développés en utilisant la technologie informatique qui sont combinées avec divers types de logiciels pour créer un laboratoire virtuel dans lequel les plantes virtuelles sont cultivées dans des situations strictes et contrôlées. La possibilité d’exécuter simultanément un certain nombre de simulations différentes permet d’accélérer considérablement le processus de recherche. La botanique algorithmique crée une situation dans laquelle les botanistes sont libres d’explorer les possibilités dans un laps de temps très court, plutôt que les années ou les décennies que des efforts similaires nécessiteraient dans des circonstances réelles.

Les groupes de chercheurs BMV de l’Université de Calgary ne sont pas seuls dans leur travail. Des personnes du monde entier sont impliquées à différents niveaux dans le projet. Le travail est essentiellement divisé en trois volets principaux. La modélisation est la composante de base et implique la création de la fondation pour les usines virtuelles. La simulation s’appuie sur la base créée par la modélisation et permet aux chercheurs d’introduire une gamme de facteurs contrôlés dans l’environnement virtuel de chaque modèle. La visualisation des plantes permet l’étude du produit final qui est produit par la série de facteurs qui sont introduits, fournissant des informations précieuses sur la faisabilité et l’opportunité d’utiliser ces facteurs dans une application du monde réel.

Au cours du mois de novembre 2007, les personnes intéressées par les progrès de la botanique algorithmique se sont réunies lors du cinquième atelier annuel de modélisation fonctionnelle et structurelle des plantes. Tenu à Napier, en Nouvelle-Zélande, l’atelier était ouvert aux personnes associées au projet de l’Université de Calgary, ainsi qu’aux chercheurs indépendants employant une forme de botanique algorithmique dans leurs efforts.