A relação entre percepção e comportamento organizacional decorre do papel que a percepção de um funcionário sobre os fatores de uma organização influencia a maneira como ele reage ou atua na organização. Esse processo de perceber algo é realmente complicado, muitas vezes moldado por noções individuais preconcebidas a respeito de certos fatores. Como tal, é possível que duas pessoas olhem para o mesmo objeto e ainda consigam percebê-lo de maneiras totalmente diferentes. Às vezes, há certos aspectos que se prestam a um tipo de percepção mais uniforme do que outros, mesmo que ainda existam algumas variações como resultado de características individuais e processos cognitivos. Para tanto, a ligação entre percepção e comportamento organizacional pode ser vista na maneira como os funcionários percebem a vida social na organização, os aspectos formais da organização e outros fatores, como os padrões éticos da organização.
Uma das formas de conexão entre percepção e comportamento organizacional é a maneira como os funcionários que compõem a organização veem os fatores formais na organização, como os objetivos corporativos e seus papéis esperados. Supondo que uma empresa de entrega de encomendas tenha declarado que seu principal objetivo corporativo é ganhar a confiança e a confiança de seus clientes, com base em sua promessa de entregar encomendas em seus destinos, conforme prometido, não importa o quê, a maneira como os funcionários percebem esse objetivo afetará o maneira pela qual trabalham para atingir a meta. Dessa forma, um funcionário que pode vir de uma empresa que dá uma declaração, mas quer dizer algo diferente, pode não ter o mesmo respeito ou consideração pelos objetivos da empresa como alguém que está acostumado com organizações que dizem exatamente o que querem dizer. Nesse sentido, os dois funcionários se deparam com os mesmos objetivos corporativos, mas optam por percebê-los de maneiras diferentes que levam a reações diversas às expectativas da empresa de que seus funcionários cumprirão esse objetivo. A relação entre a percepção e o comportamento organizacional pode ser vista neste caso devido ao fato de que o funcionário que respeita as metas tentará o máximo possível se conformar, enquanto o que não o fará provavelmente não sairá do seu caminho respeitar o objetivo da empresa.
Outra maneira pela qual a percepção e o comportamento organizacional estão ligados é na forma como os funcionários percebem os padrões éticos da empresa. Uma empresa que emprega um padrão duplo no tratamento dos funcionários terá diferentes percepções de diferentes grupos, levando a resultados diferentes. Por exemplo, uma empresa que trata minorias ou mulheres com menos consideração do que outras será vista de várias maneiras por elas. Os funcionários bem tratados sentirão que a empresa é um bom lugar para se trabalhar, enquanto os que são tratados injustamente nutrirão sentimentos de ressentimento em relação à organização.