L’endoderme, ou entoderme, est l’une des trois couches germinales embryonnaires qui, ensemble, donnent naissance à tous les tissus et organes matures du corps. De l’intérieur vers l’extérieur, les trois couches cellulaires sont l’endoderme, le mésoderme et l’ectoderme. Les couches cellulaires apparaissent au début du développement embryonnaire, lorsqu’une cavité appelée archenteron se forme au centre de la blastula, une minuscule boule de cellules indifférenciées, et les cellules commencent à se réorganiser en couches germinales. L’endoderme est le premier à se former et commence à se former dans l’embryon humain environ deux semaines après la fécondation. À la cinquième semaine, l’endoderme s’est déjà différencié en organes.
Les trois couches cellulaires sont à peu près équivalentes à la position des structures dans le corps humain entièrement formé, l’endoderme formant des structures internes, l’ectoderme formant des structures externes et le mésoderme formant des structures intermédiaires comme le squelette, le muscle squelettique et le cœur. Certains animaux n’ont pas de mésoderme. L’archenteron est le précurseur de l’intestin, ou tube digestif, et son apparition marque le début de la formation des couches germinales, un processus appelé gastrulation.
Les cellules de l’endoderme sont d’abord plates, mais deviennent colonnaires, leur hauteur dépassant leur largeur, au fur et à mesure qu’elles se différencient. Ils finissent par former la muqueuse du système digestif du corps humain, à l’exception de certaines parties de la bouche, de la gorge et du rectum. L’endoderme donne également naissance à une grande partie du tissu épithélial interne qui tapisse les organes et les glandes.
L’endoderme forme également les voies respiratoires des poumons : la trachée, les bronches et les alvéoles. Il tapisse toutes les glandes qui s’ouvrent dans le tube digestif, y compris le pancréas et le foie, ainsi que les follicules du thymus, qui produisent des lymphocytes T ou des cellules T, et la glande thyroïde, qui produit un certain nombre d’hormones régulatrices importantes. Il donne également naissance à l’épithélium de la trompe d’Eustache et de la cavité tympanique de l’oreille, ainsi qu’à la vessie et à l’urètre.