Il existe environ 75,000 XNUMX espèces de champignons identifiées scientifiquement, les scientifiques estimant qu’il pourrait y avoir jusqu’à un million d’espèces fongiques non encore identifiées. Comme différentes espèces peuvent se ressembler superficiellement, les classer avec précision est difficile et nécessite généralement l’application d’outils moléculaires tels que le séquençage de l’ADN. Comme le séquençage de l’ADN est encore relativement coûteux, même pour les champignons dont le génome est beaucoup plus court que celui des mammifères, il faudra probablement plusieurs décennies avant que la majorité ne soit classée avec certitude.
Les types courants incluent les moisissures – qui se développent en brins appelés hyphes, les champignons – les fructifications des colonies fongiques et les levures – le nom de tout champignon unicellulaire. Cependant, ce sont des termes généraux, et les moisissures, les levures et les champignons peuvent être trouvés dans plusieurs catégories taxonomiques. La classification des champignons au niveau des phyla est compliquée et est constamment remaniée. Les champignons ont d’abord été classés à tort comme des plantes, mais des enquêtes ultérieures ont révélé qu’ils avaient en fait plus en commun avec les animaux. Comme les plantes et les animaux, ce sont des eucaryotes.
Du point de vue phylogénétique, il existe sept phylums de champignons. Le premier est le Chytridiomycota, ou chytrides, la forme la plus primitive, avec environ 1,000 XNUMX espèces identifiées. Ceux-ci produisent des spores avec des flagelles (zoospores) et s’attaquent aux amphibiens, au maïs, à la luzerne, aux pommes de terre et à d’autres organismes vulnérables. Ce sont les plus représentatifs des types qui ont vécu tout au long de l’ère paléozoïque, étant principalement aquatiques.
Blastocladiomycota est le deuxième phlya, créé seulement en tant que catégorie distincte en 2007. Comme les chytrides, ils utilisent des zoospores pour se reproduire et sont des parasites de tous les principaux groupes eucaryotes. Le troisième phyla, les Neocallimastigomycota, sont des champignons anaérobies qui occupent principalement l’estomac des ruminants. Leur nom contient le suffixe grec désignant les fouets, -mastix, pour leurs nombreux flagelles. Les deuxième et troisième phylums ont tous deux été initialement classés à tort comme des chytrides.
Le quatrième phyla est le Zygomycota, plus connu, du nom des spores sphériques robustes qu’il produit. Si vous voyez un champignon avec de minuscules points au bout des hyphes (filaments), c’est du Zygomycota. Il existe plus de 600 espèces de ce genre, et il comprend la moisissure noire du pain, l’une des plus fréquemment observées par l’homme. Un autre est Pilobolus, qui est capable d’éjecter des spores à plusieurs mètres dans l’air.
Le cinquième phyla est le Glomeromycota, connu sous le nom de champignons mycorhizes arbusculaires (AM). Fondamentalement, ce terme signifie champignons des arbres. On les retrouve en grand nombre dans les racines de plus de 80 % des familles de plantes vasculaires. Cette relation est symbiotique et ancienne, remontant à au moins 460 millions d’années, jusqu’au début de la vie végétale sur terre.
Le sixième phyla est l’Ascomycota, connu sous le nom de champignon sac. Ceux-ci forment des sacs sphériques distincts pour contenir leurs spores et contiennent le plus d’espèces de tous les phylums. Les exemples incluent Penicillium, morilles, truffes, levure de boulanger, lichens, oïdium et bien d’autres. Beaucoup de ces embranchements sont phytopathogènes.
Les septièmes phylums sont les Basidiomycota, ou les champignons du club. Ce groupe contient les champignons les plus courants. Elle se distingue par la présence d’une structure productrice de spores appelée la baside, plus communément appelée calotte. Avec Ascomycota, ils sont connus sous le nom de Higher Fungi.