Obwohl sowohl Loratadin als auch Cetirizin Arten von Antihistaminika sind, handelt es sich jeweils um unterschiedliche chemische Verbindungen, die die Symptome von Allergien auf unterschiedliche Weise behandeln. Beide Medikamente werden für die gleichen Arten von Allergien verabreicht und sind beide wirksam gegen Niesen, Nasenjucken und tränende Augen und unwirksam gegen Symptome wie Nesselsucht und systemische allergische Reaktionen. Trotz der Ähnlichkeiten in der Wirkung dieser Medikamente sind ihre chemischen Zusammensetzungen unterschiedlich und haben daher unterschiedliche Auswirkungen auf Patienten, die sie einnehmen.
Molekular sind diese Stoffe unterschiedlich aufgebaut. Loratadin besteht aus 22 Kohlenstoffatomen, 23 Wasserstoffatomen, zwei Stickstoffatomen, zwei Sauerstoffatomen und einem Chloratom. Diese Atome sind zu einem Molekül angeordnet, das eine Reihe verschiedener Verzweigungen aufweist. Cetirizin besteht aus 21 Kohlenstoffatomen, 25 Wasserstoffatomen, drei Sauerstoffatomen, zwei Stickstoffatomen und einem Chloratom, die zu einer langen Kette angeordnet und mit zwei Hydrochloridmolekülen verbunden sind. Obwohl die Bausteine ähnlich sind, ermöglicht die Anordnung dieser Moleküle es ihnen, Allergiesymptome auf unterschiedliche Weise zu bekämpfen.
Einer der Hauptunterschiede zwischen Loratadin und Cetirizin sind die Arten von Nebenwirkungen, die bei Patienten bei der Einnahme auftreten können. Während bei der Anwendung dieser beiden Medikamente Mundtrockenheit und Magen-Darm-Beschwerden auftreten, ist Loratadin auch dafür bekannt, Kopfschmerzen, Mundwunden, Nervosität und Ruhelosigkeit zu verursachen. Cetirizin hingegen kann Schläfrigkeit verursachen, die bei einigen Patienten schwerwiegend sein kann. Es ist auch möglich, dass Patienten, die Cetirizin einnehmen, Schwierigkeiten beim Atmen haben, eine Nebenwirkung, die normalerweise bei Patienten, die Loratadin einnehmen, nicht auftritt, es sei denn, der Patient befindet sich in einer Anaphylaxie.
Ein weiterer Unterschied zwischen Loratadin und Cetirizin besteht darin, wie jedes Medikament verabreicht werden kann. Erwachsene erhalten in der Regel einmal täglich eine Dosis von 10 Milligramm eines dieser Medikamente, während Kinder über zwei Jahren oft die Hälfte dieser Menge erhalten. Für Kinder unter zwei Jahren gibt es keine festgelegte Dosierung von Loratadin, während Kinder zwischen sechs Monaten und zwei Jahren 2.5 Milligramm Cetirizin sicher einnehmen können.
Auch die Langzeitwirkungen hoher Dosen von Loratadin und Cetirizin sind unterschiedlich. In Labortests erhöhte Cetirizin weder das Krebsrisiko noch verringerte es die Fertilität, selbst wenn es in Dosierungen verabreicht wurde, die deutlich über der empfohlenen Höchstdosis lagen. Extrem hohe Dosen von Loratadin führten jedoch zu einem erhöhten Krebsrisiko sowie zu einer Abnahme der männlichen Fertilität.