Nach einem standardmäßigen Fettabsaugungsverfahren wird das Lipofett normalerweise in einem speziellen Biohazard-Behälter für medizinische Abfälle versiegelt. Anschließend wird es in einer dafür vorgesehenen Verbrennungsanlage verbrannt. Während einige Chirurgen Körperfett auf dem gleichen Klinik- oder Krankenhausgelände auf diese Weise entsorgen können, vergeben viele von ihnen diese Arbeit an ein lokales Entsorgungsunternehmen für medizinische Abfälle. Abfälle nach einer Fettabsaugung stellen ein Kontaminationsrisiko dar, ebenso wie andere Arten von menschlichem biologischem Material, das während einer Operation entfernt wird, und sie müssen mit den richtigen Verfahren für den Umgang mit dieser Art von biologisch gefährlichen Abfällen entsorgt werden.
Bei der Fettabsaugung wird eine Fettschicht unter der Haut durch Vakuumabsaugung entfernt. Es wird normalerweise unter Vollnarkose oder Lokalanästhesie mit einem medizinischen Instrument, einer sogenannten Kanüle, durchgeführt, und der gezielte Fettabbau muss normalerweise durch die Hin- und Her-Manipulation der Kanüle durch den Chirurgen aufgebrochen werden. Es kann dann durch einen an der Kanüle befestigten Schlauch zu einem Sammelbehälter wandern. Personen, die sich für eine Fettabsaugung entscheiden, tun dies in der Regel als zusätzlichen Ausweg nach einer Kalorienreduktion und Bewegung, bei der nicht genügend Fettgewebe von bestimmten Körperbereichen entfernt wurde.
Einige plastische Chirurgen verwenden in begrenztem Umfang auch Fett zur Fettabsaugung für andere Arten von kosmetischen Eingriffen wie Brustvergrößerung, Gesichtsfaltenauffüllung oder Lippeninjektionen; diese werden auch als Fetttransferverfahren bezeichnet. Gute Kandidaten für Fetttransfer-Injektionen sind solche mit Gesichts- oder Körperbereichen, die durch eine deutliche Volumenfüllung verbessert werden könnten. Aufgrund der natürlichen Zusammensetzung der menschlichen Fettzellen bevorzugen manche Ärzte die Verwendung von Fett zur Fettabsaugung gegenüber synthetischen Injektionsfüllern.
Medizinische Forscher experimentieren routinemäßig mit möglichen Verwendungen von Fett zur Fettabsaugung bei der Entwicklung von Stammzellen. Erwachsene menschliche Fettzellen enthalten das gleiche grundlegende biologische Material wie embryonale Stammzellen, und dieses Material kann manchmal mit bestimmten mikroskopischen Werkzeugen extrahiert werden. Es kann dann möglicherweise in gesunde Stammzellen umgewandelt werden, die möglicherweise verwendet werden können, um Gewebeschäden durch Verletzungen oder andere körperliche Defekte zu reparieren.
Fettabfälle aus der Fettabsaugung haben auch ein gewisses Potenzial als Material für Biodieselkraftstoff. Einigen Wissenschaftlern ist es gelungen, Abfälle nach der Fettabsaugung so zu verflüssigen, dass sie zum Betanken spezieller Biodieselmotoren verwendet werden können, obwohl die durchschnittliche Kraftstoffmenge etwas geringer sein kann als die ursprüngliche Menge der Körperfettabfälle. Diese Verwendung von entferntem Lipofett ist im Allgemeinen experimentell und kann in bestimmten Bereichen manchmal rechtlichen Beschränkungen unterliegen.