Ausgehend von der romanischen Architektur wurde die gotische Architektur im Hoch- und Spätmittelalter, meist vom 13. Jahrhundert bis zum 16. Jahrhundert, populär. Dies bedeutet, dass gotische Buntglasfenster um 1200 ihr Debüt gaben und bis ins 1500. Jahrhundert blieben. Meistens zeigten gotische Buntglasfenster religiöse Szenen, obwohl manchmal die bunten und durchscheinenden Glasstücke, aus denen die Fenster bestanden, in aufwendigen Designs ohne Rücksicht auf eine Person oder ein Ereignis angeordnet waren.
Obwohl sowohl die gotische Architektur als auch die romanische Architektur in Gesamtform und Größe ähnlich waren, präsentierte die gotische Architektur ausgefallenere Fassaden, spitzere Bögen und längere und breitere Fenster. Architekten haben diese Fenster aus verschiedenen Gründen länger und breiter entworfen. Ästhetik könnte einer davon gewesen sein. Dass einige gotische Gebäude jedoch viel höher wurden als ihre romanischen Cousins, scheint der häufigste Grund für die größeren Fenster zu sein. Architekten füllten die Öffnungen von immenser Größe, an die die Gebäude und die Menschen noch nicht gewöhnt waren, das, was heute als gotische Glasmalerei bezeichnet wird.
Im Allgemeinen umfassten die Gebäude, die mit genügend Reichtum verbunden waren, um sich Buntglasfenster leisten zu können, Gebäude, die mit Königen, Adel und Religion verbunden waren. In dieser Zeit war Religion ein alltäglicher Bestandteil des Lebens. So wurden königliche Besitztümer wie Burgen ebenso wahrscheinlich mit Religion in Verbindung gebracht wie Kirchen, Kathedralen und andere religiöse Häuser.
Dementsprechend zeigten die meisten Glasmalereien religiöse Szenen oder Geschichten, die in irgendeiner Weise mit Religion zu tun hatten. Die durchscheinenden, mehrfarbigen Glasmosaikstücke wurden zusammengefügt, um Menschenszenen aus biblischen Geschichten oder Bilder aus dem Leben eines Heiligen zu zeigen. Die Glasmalereien, aus denen solche Szenen bestanden, waren reich gefärbt und mit Bleikammen oder Trennleisten verbunden. Manchmal war jedes einzelne Fenster eine Szene für sich. Manchmal bildeten mehrere Fenster zusammen eine ganze Szene.
Doch nicht alle gotischen Glasmalereien zeigten religiöse Szenen. Einige präsentierten farbenprächtige Gläser in verschiedenen Größen, die in komplexen Mustern angeordnet waren. Diese Muster ähnelten den religiösen Szenen in Bezug auf die Präsentation. So wie zum Beispiel die Szenen auf gotischen Glasfenstern, die Schlösser und Kirchen schmückten, aus einem oder mehreren Fenstern bestehen konnten, konnten die Glasmalereien auch aus einem oder mehreren Fenstern bestehen. Ein einzelnes Fenster kann ein makelloses Muster aus Kreisen, Quadraten, Dreiecken und anderen Formen darstellen, oder das Muster kann sich über mehrere benachbarte Fenster erstrecken.