Várias características são necessárias no design de um incubatório ideal para garantir que a instalação seja segura, limpa e fácil de usar. Um incubatório bem projetado será mais produtivo, com menos risco de perda e mais potencial para aumentar o estoque adicional à medida que as operações do incubatório se expandem. Também deve cumprir as leis vigentes que dizem respeito a incubatórios e criação de animais.
Os incubatórios são usados com a finalidade de incubar os ovos de aves e peixes para eclodir jovens vivos e depois criar os filhotes até que tenham idade suficiente para serem vendidos ou transportados para outro local. Os incubatórios industriais operam continuamente, apresentando sérios desafios de projeto, pois precisam abrigar ovos e filhotes em vários estágios de desenvolvimento. As considerações do projeto variam, dependendo se a instalação está sendo usada para aves ou peixes.
Nos dois casos, um incubatório ideal possui excelente ventilação e um design que facilita a limpeza para manter o espaço o mais higiênico possível. Deve incluir áreas separadas para incubar ovos e abrigar filhotes para reduzir a propagação da doença, além de uma área segura para armazenar alimentos e um amplo suprimento de água fresca. Um incubatório ideal também possui protocolos claros para os trabalhadores, como a proibição de passar entre as áreas de incubação e de criação para manter essas áreas o mais separadas possível.
Na área onde os ovos são incubados e chocados, é preciso haver muito espaço para se movimentar, além de espaço para isolar diferentes espécies ou raças. Em um incubatório de aves, diferentes raças podem ser incubadas em incubadoras e bandejas separadas, enquanto em um incubatório de peixes, diferentes tanques serão utilizados para manter as espécies separadas. O espaço também deve ser fácil de monitorar, para que a equipe possa estar alerta para o desenvolvimento de problemas como flutuações de temperatura ou impurezas na água.
Nas áreas de ninhada em que os filhotes são retirados depois de eclodirem, a limpeza é fundamental. Altos volumes de animais jovens podem gerar uma quantidade impressionante de lixo, e esse lixo precisa ser coletado e descartado com responsabilidade. Também é necessário adotar medidas para alimentar e isolar os animais, a fim de confirmar que eles são saudáveis antes de permitir que eles se misturem com a população em geral. Uma área de processamento para preparar os animais para embarque também é uma parte importante do projeto em um incubatório ideal.
Ter espaço para os animais é obviamente a chave para um incubatório ideal, mas também é necessário espaço para os seres humanos. Os incubatórios precisam manter registros extensos dos animais que reproduzem, o que exige muito espaço para escritório. Muitos também precisam fornecer alguns serviços veterinários, incluindo serviços básicos, como medir e pesar animais jovens, e os funcionários também precisam de um lugar para trocar, com alguns incubatórios tendo salas de descanso e áreas de banho também.