Il sequenziamento dell’RNA è il processo di determinazione della sequenza dei nucleotidi in un filamento di acido ribonucleico, o RNA. L’RNA è composto da quattro nucleotidi chiamati adenina (A), guanina (G), citosina (S) e uracile (S). La particolare sequenza dei nucleotidi è un “codice” contenente informazioni genetiche utilizzate per produrre diversi tipi di proteine o per svolgere da solo una funzione specifica. I codici genetici sotto forma di sequenze di nucleotidi definiscono quasi tutti i processi biologici che coinvolgono lo sviluppo e la funzione di un organismo. Il sequenziamento dell’RNA, quindi, è un tipo di ricerca volto a scoprire la natura precisa di quel codice genetico ea connettere il codice a strutture e funzioni specifiche all’interno di un organismo.
Gli scienziati sequenziano l’acido desossiribonucleico, o DNA, molto più spesso di quanto sequenziano l’RNA. Il DNA è similmente costituito da nucleotidi, ma sono disposti a doppia elica. Le “trascrizioni” di RNA sono in realtà realizzate in base alla sequenza di nucleotidi su un filamento di DNA: il DNA tende ad essere più robusto dell’RNA perché molti filamenti di RNA devono essere costituiti da una singola sequenza di DNA. Inoltre, il DNA contiene “introni” o segmenti non codificanti di DNA, che vengono eliminati durante il processo di trascrizione e, pertanto, non vengono rilevati dal sequenziamento dell’RNA. Il sequenziamento dell’RNA è ancora importante, sebbene in molti casi sia necessario prima “trascrivere inversamente” l’RNA in DNA prima di sequenziarlo.
Il fatto che una sequenza di RNA non sia necessariamente uguale alla sequenza di DNA da cui è stata trascritta è uno dei motivi principali per cui gli scienziati conducono effettivamente esperimenti di sequenziamento dell’RNA. Il sequenziamento dell’RNA consente agli scienziati di scoprire quali parti di un modello di DNA sono state eliminate durante la trascrizione. Sapendo questo, possono quindi esaminare come e perché la sequenza è stata modificata. Uno dei problemi interessanti in biologia è il fatto che gran parte del genoma, o sommatoria dell’informazione genetica all’interno di un organismo, sembra non essere utilizzata. Imparare esattamente quali sequenze vengono utilizzate e quali no è un passo importante nell’esplorazione delle complessità di questi segmenti inutilizzati di informazioni genetiche.
Lo sviluppo di metodi più efficienti ed efficaci di sequenziamento dell’RNA è un obiettivo importante di molti ricercatori nel campo delle biotecnologie. I ricercatori devono generalmente eseguire la trascrizione inversa dell’RNA in DNA prima di prendere effettivamente la sequenza. I ricercatori vogliono sviluppare metodi che consentano un efficiente sequenziamento diretto dell’RNA senza danneggiare i filamenti di RNA. Inoltre, i ricercatori vogliono trovare metodi ad alto rendimento che consentano loro di sequenziare molti filamenti di RNA durante un processo di sequenziamento dell’RNA.