El micelio es la porción vegetativa de un hongo, lo que significa que es la porción que se propaga a través de la reproducción asexual. Consiste en una red de hifas, ramificadas o bifurcadas estructuras en forma de hilo. Dependiendo del tipo de hongo y de lo bien desarrollado que esté, el micelio puede ser visible o microscópico. El moho que crece en los alimentos en descomposición, por ejemplo, es una forma visible.
Además de la reproducción asexual, el micelio se encarga de absorber los nutrientes del medio ambiente. Libera enzimas en el entorno circundante para descomponer la fuente de alimento en una forma digerible y luego la absorbe. Este proceso también ayuda a que el material vegetal muerto y otros materiales orgánicos se descompongan. El material también puede ayudar a renovar el suelo a través de este proceso, por ejemplo, al descomponer contaminantes como pesticidas. Algunos micelios ayudan a las plantas a absorber el agua y los nutrientes de manera más eficiente, y otros también son importantes fuentes de alimento para los invertebrados que viven en el suelo.
El micelio también puede ser extremadamente extenso. Una colonia de hongos notoria en el bosque del este de Oregon una vez cubrió 2,400 acres (9.7 kilómetros cuadrados). Creció a tal tamaño durante unos 2,200 años y mató el crecimiento de las plantas en el bosque muchas veces, cada vez conduciendo a capas más profundas de suelo que podían soportar el crecimiento de árboles cada vez más grandes.
A veces, el micelio se utiliza en agricultura o jardinería. Además de su capacidad para reponer nutrientes, algunos tipos de hongos forman una relación simbiótica, llamada micorriza, con las raíces de una planta. La planta y el hongo se ayudan mutuamente a recibir nutrientes que no podrían obtener por sí mismos. El micelio también se puede utilizar como filtro orgánico para el suelo o el agua en un proceso llamado micofiltración, en el que una estera micelial evita la entrada de productos químicos y microorganismos nocivos. A veces también se utilizan para mantener la tierra nueva en su lugar en caminos sin pavimentar.
Algunos tipos de hongos utilizan tanto la reproducción sexual como la reproducción asexual. La porción de un hongo que se reproduce sexualmente surge del micelio y se llama esporocarpio o cuerpo fructífero. Los cuerpos fructíferos de muchos tipos diferentes de hongos se conocen como hongos o trufas, aunque existen algunos otros tipos.