La zymographie est une technique réalisée par des biochimistes dans laquelle des particules sont dispersées à l’aide d’une charge électrique dans un processus connu sous le nom d’électrophorèse. Plus précisément, le processus utilise un substrat dans lequel une enzyme réagira par polymérisation avec un gel de polycrylamide, une solution à base d’eau faite de matériaux toxiques. Ce gel de zymogramme est connu sous le nom de gel de polyacrylamide de dodécyl sulfate de sodium (SDS-PAGE).
Un biochimiste effectuant une zymographie préparera le gel de zymogramme en utilisant la méthode d’électrophorèse. Habituellement, cette méthode est effectuée en conjonction avec l’ébullition ou la réduction du gel. Cependant, en zymographie, le gel SDS-PAGE est conservé intact. Après cette étape, la partie SDS du composé est éliminée à l’aide d’un matériau connu sous le nom de Triton X-100™, un détergent d’oxydation de la société BASF™. Ce matériel est maintenu à 98°F (environ 37°C) pendant un certain temps dans un incubateur avancé. Un biochimiste colorera ensuite le matériau restant à l’aide d’un composé noir ou bleu. Cela permet à un chercheur d’identifier où et comment la digestion se produit par les enzymes de la substance.
Alors que le gel SDS-PAGE est la substance la plus couramment utilisée en zymographie, d’autres types de matériaux peuvent être utilisés pour identifier la vitesse de digestion et la capacité d’une enzyme. Plusieurs fois, cela comprend l’ajout d’un film d’amidon pour aider le processus d’identification visuelle.
Les biochimistes et les ingénieurs biomédicaux utilisent couramment ce processus dans le but de découvrir de nouvelles formes d’enzymes. En définissant le taux de digestion et les schémas de mouvement d’une enzyme, les différentes propriétés des protéines humaines et animales peuvent être identifiées. Ceci est utilisé pour certaines recherches et analyses génétiques ainsi que pour des applications de médicaments et de médicaments.
Le processus de zymographie doit être manipulé avec soin. Bien que cela puisse principalement être fait avec des précautions de sécurité minimales, tout scientifique ou chercheur manipulant les matériaux doit s’assurer d’éviter tout contact physique. Le détergent Triton X-100™ et le gel SDS-PAGE peuvent être hautement toxiques pour la peau.
Il existe un certain nombre d’enzymes qui ne répondent pas comme prévu à ce processus. Par exemple, les glycosidases digestives de D. melanogaster peuvent survivre aux processus de réduction dans d’autres types d’examens digestifs. De plus, il survivra au processus de chauffage jusqu’à 122 °F (environ 50 °C), bien au-delà du niveau requis dans le processus zymographique traditionnel. Lorsqu’une enzyme survit au processus sans digérer complètement le gel SDS-PAGE, une résolution de bande accrue est observée aux étapes finales. Cela peut entraîner des problèmes pour obtenir des résultats corrects du processus de zymographie.