Dinkel und Weizen werden häufig in Brot und Backwaren verwendet und weisen je nach Rasse leichte Unterschiede in Textur, Geschmack und Nährstoffgehalt auf. Obwohl sowohl Dinkel als auch Weizen Gluten enthalten, das ein Protein ist, enthält Dinkel einen höheren Anteil an Proteinen und Aminosäuren. Ihre Geschmacksunterschiede variieren leicht, abhängig von ihrer spezifischen Rasse, Verarbeitungs- und Kochmethode, was dazu führt, dass einige Personen in Backrezepten das andere durch das andere ersetzen. Beide Getreidesorten sind für Zöliakie-Betroffene oder Menschen mit Glutenunverträglichkeit ungeeignet, da sie aus derselben Getreidefamilie stammen und beide Gluten enthalten.
Es ist nicht ungewöhnlich, dass in alternativen Rezepten Dinkelmehl verwendet wird, ein uraltes Getreide, das älter ist als Weizen und andere zum Backen und Kochen geeignete Körner. Dinkel- und Weizenmehl können in einem Rezept austauschbar verwendet werden und können in jeder Backware leicht durch das andere ersetzt werden. Der Unterschied in Textur und Geschmack ist leicht wahrnehmbar und wird oft als Vollkorn gedünstet und nicht verfeinert, bevor es zu einem Mehl gemahlen wird. Die Verwendung von Dinkelmehl anstelle von Weizenmehl, ob ganz oder raffiniert, führt oft zu einem dichteren Brot und einem nussigeren, süßeren Geschmack.
Der Körner Dinkel enthält je nach Dinkelrasse etwas mehr Nährstoffe in seinem Nährwertprofil als normaler Weizen. So wird Dinkel in gesunden Rezepten oft gefordert, um den Nährwert einer Backware zu erhöhen und den Proteingehalt zu erhöhen. Obwohl Dinkel etwas mehr Nährstoffe enthält als Weizen, produziert er dennoch nicht unbedingt eine nennenswerte Menge an Nährstoffen, die für den täglichen Energiebedarf benötigt werden. Weizenmehl und insbesondere raffiniertes Weißweizenmehl unterscheidet sich oft von Dinkelmehl sowohl in seinen Nährstoffen als auch in seinem leichteren Geschmack und seiner Textur, die in seinen Backwaren erzeugt werden.
Manchmal wird vermutet, dass Dinkel für Personen mit Glutenunverträglichkeit oder Zöliakie sicher ist, einer Erkrankung, die zu einem schlechten Abbau des Glutenproteins führt. Dies ist falsch, da Dinkel und Weizen aus derselben Familie stammen und beide das Glutenprotein enthalten, das die innere Auskleidung des Dünndarms verletzen kann. Weizen ist oft das am häufigsten verwendete Getreide für Backwaren wie Brot und Kuchen, da es weniger teuer und auf dem Markt besser verfügbar ist. Daher variieren Dinkel- und Weizenmehle oft im Preis, wobei Dinkelmehl in einigen Märkten etwas höher ist als Weizenmehl.