Die Bakterienklassifizierung ist der Prozess, Bakterienarten voneinander zu unterscheiden und sie nach gemeinsamen Merkmalen zu gruppieren. Eine solche Klassifizierung erfolgt im Rahmen des international anerkannten Systems der biologischen Taxonomie oder der Wissenschaft der Klassifizierung von Organismen. Bei der Klassifizierung von Bakterien werden eine Reihe von Dingen berücksichtigt, insbesondere RNA-Sequenzen, aber auch Form, Biochemie und Eigenschaften der äußeren Membran.
Während es unterschiedliche Ansichten darüber gibt, wie Organismen klassifiziert werden sollten, unterteilt das derzeit vorherrschende System alles Leben in drei Bereiche. Bakterien bilden eine dieser Domänen. Sie weisen eine extreme Diversität auf und machen zahlenmäßig die große Mehrheit der bekannten Arten aus und sind zahlenmäßig allen vielzelligen Organismen auf der Erde überlegen. Die Klassifizierung von Bakterien kann aufgrund einer Reihe von Faktoren schwierig sein, insbesondere aufgrund des Fehlens komplexer Strukturen in fortgeschritteneren Organismen sowie der Tendenz von Bakterien, DNA-Segmente zu übertragen.
Bakteriologen verwenden eine Reihe von Techniken zur Klassifizierung von Bakterien. Form ist der einfachste Weg, Bakterien zu unterscheiden, und diese Organismen können eine Vielzahl von Formen aufweisen, darunter unter anderem Stäbchen, Spiralen und Kugeln. Die Form ist jedoch nicht unbedingt ein exklusives Merkmal, und Bakterien, die in sehr unterschiedliche Klassifikationen eingeteilt werden, können ähnliche Formen haben.
Andere morphologische Merkmale wie die Größe können von Art zu Art erheblich variieren, und typische Gruppierungen können auch bei der Klassifizierung helfen. Viele Arten neigen dazu, Gruppen einzelner Zellen zu bilden, deren Anzahl stark variieren kann. Das Vorhandensein von äußeren Strukturen, wie winzigen tentakelartigen Konstruktionen, die Flagellen genannt werden, kann auch helfen, Bakterienarten zu unterscheiden.
Ein weiteres wichtiges Werkzeug bei der Bakterienklassifizierung ist ein Test, der als Gram-Färbungstest bekannt ist und nach einem Mikrobiologen aus dem 19. Jahrhundert benannt wurde. Dieser Test quantifiziert Bakterien entsprechend der Dicke ihrer äußeren Membran. Gram-negative Bakterien haben eine sehr dünne Membran und gram-positive Bakterien haben eine dickere Membran.
Faktoren wie Stoffwechsel und andere biochemische Unterscheidungen sind ein weiteres Instrument zur Klassifizierung von Bakterien. Bakterien metabolisieren eine Vielzahl verschiedener Verbindungen, und die bestimmte Verbindung oder Verbindungen, die von einem bestimmten Bakterium verwendet oder umgewandelt werden, können bei seiner Identifizierung und Klassifizierung helfen. Auch die Analyse anderer biochemischer Daten kann diesen Prozess unterstützen.
Fortschritte bei molekularen Analysetechniken haben es Bakteriologen ermöglicht, Bakterien anhand von Unterschieden in der RNA sowie anhand spezifischer Gensequenzen zu differenzieren. Eine weitere Analyse der Gesamtmenge einzelner RNA- und DNA-Proteine und der Verhältnisse, in denen sie vorhanden sind, bieten ein weiteres Mittel zur Klassifizierung. Mit einigen oder allen dieser Techniken und beobachtbaren Merkmalen sind Bakteriologen in der Lage, Bakterien nach Spezies zu klassifizieren und ähnliche Spezies zu gruppieren.