RNA-Analyse ist ein weit gefasster Begriff, der sich auf eine Vielzahl von Techniken bezieht, die beim Sammeln von Daten über eine Sequenz von Ribonukleinsäure (RNA) beteiligt sind. Desoxyribonukleinsäure (DNA) enthält die genetischen Anweisungen, die fast jeden Aspekt des Aussehens und Verhaltens der verschiedenen Teile eines Organismus bestimmen. Teile dieser DNA werden in RNA transkribiert, und RNA-Stränge werden dann in Proteine oder funktionelle chemische Einheiten übersetzt, die für die meisten chemischen und strukturellen Aspekte von Organismen direkt oder indirekt essentiell sind. Einige RNA-Formen werden nicht in Proteine übersetzt, sondern sind aufgrund ihrer eigenen chemischen Eigenschaften funktionell. Die RNA-Analyse dient normalerweise dazu, den genetischen Code eines bestimmten RNA-Strangs zu lesen, kann aber auch dazu dienen, andere strukturelle oder funktionelle Merkmale aufzudecken.
Eine der gebräuchlichsten und grundlegendsten Arten der RNA-Analyse ist die Sequenzanalyse. RNA besteht aus vier Arten von Molekülen, die als Nukleotide bekannt sind: Adenin, Guanin, Cytosin und Uracil. Die Bestimmung der Nukleotidsequenz in solchen RNA-Ketten ermöglicht es Forschern, die Struktur eines resultierenden Proteins vorherzusagen oder nach Mutationen in der Sequenz zu suchen. Die Sequenzanalyse kann auch verwendet werden, um die Strukturen von RNA-Ketten vorherzusagen, die für sich allein funktionsfähig sind und nicht in Proteine übersetzt werden.
Eine weitere relativ häufige Form der RNA-Analyse ist die Strukturanalyse, die darauf abzielt, die Sekundärstruktur einer bestimmten RNA-Kette zu bestimmen. Die Funktionen von RNA-Ketten, die nicht in Proteine übersetzt werden, ergeben sich aus ihren dreidimensionalen Strukturen, die allgemein als Sekundärstrukturen bezeichnet werden. Das Verständnis der Sekundärstruktur einer RNA-Kette durch strukturelle RNA-Analyse kann Forschern helfen, die Mechanismen besser zu verstehen, durch die die RNA-Kette funktioniert. Strukturelle RNA-Analysen können durch computergestützte Vorhersagen basierend auf RNA-Sequenzierung und durch verschiedene experimentelle Methoden durchgeführt werden.
RNA kann eine Vielzahl von Funktionen haben, die über die Kodierung von Proteinen oder eingeschränkte Funktionen innerhalb eines Organismus hinausgehen. Einige dieser Funktionen sind bei bestimmten Virentypen mit RNA-Genomen offensichtlich, was bedeutet, dass alle ihre genetischen Informationen als RNA gespeichert sind. Solche Viren dringen in Wirtszellen ein und vermehren sich mit Hilfe von Proteinen, die aus dem RNA-Genom entwickelt werden können. Andere Arten von Viren verwenden einen Prozess, der als reverse Transkription bekannt ist, um DNA aus RNA herzustellen. Mithilfe der RNA-Analyse können Forscher bis zu einem gewissen Grad feststellen, wie diese Viren funktionieren, und Möglichkeiten zu ihrer Neutralisierung entwickeln.