Freud und Jung teilten eine jahrzehntelange Beziehung, als Jung, der Juniorpartner, mehr über Freuds Theorien des Unbewussten erfuhr. Glücklicherweise lehnte Jung später in der modernen Psychologie einige von Freuds Theorien ab und neigte zu seiner eigenen Methode der Psychologie, die er analytisch nannte. Beide Männer griffen zur Erklärung von Träumen auf das Konzept des Unbewussten zurück, Jung jedoch auf ein vielschichtiges Konzept des Unterbewusstseins. Die Hauptunterschiede zwischen Freud und Jung sind interessant zu beobachten.
Eine Hauptspaltung, die die beiden Psychiater trennt, betrifft die Religion. Freud hielt Religion für eine Flucht und einen Trugschluss, der nicht propagiert werden sollte. Sein Verhältnis zur Religion ähnelt dem von Karl Marx. Religion war „Opiat“ der Massen. Er glaubte voll und ganz an die Fähigkeit des Geistes, auf seine unbewussten Gedanken zuzugreifen und so jegliche Neurosen zu heilen.
Jung hingegen glaubte, dass die Religion ein wichtiger Ort der Sicherheit für den Einzelnen sei, wenn er oder sie den Prozess der Individuation begann, alle Teile des Selbst erkundete und akzeptierte. Religion war außerdem ein Kommunikationsmittel zwischen allen Arten von Menschen, denn obwohl sich die Religionen unterschieden, blieben die Archetypen und Symbole gleich.
Jung praktizierte keine traditionelle christliche Religion, sondern neigte eher zur Erforschung des Okkulten. In einigen Briefen von Freud beschuldigt er Jung des Antisemitismus, der nicht so sehr auf der Akzeptanz des Judentums als Religion beruht, sondern eher auf der Diskriminierung von Juden im Allgemeinen. Jungs Respekt vor den religiösen Aspekten des jüdischen Lebens war jedoch größer als der von Freud.
Freud und Jung waren sich nicht einig, was das Unbewusste ausmacht. Freud betrachtete das Unbewusste als eine Ansammlung von Bildern, Gedanken und Erfahrungen, die das Individuum nicht verarbeiten wollte, was zu Neurosen führte. Jung ergänzte diese Definition, indem er feststellte, dass jedes Individuum auch ein kollektives Unbewusstes besitze, eine Gruppe von gemeinsamen Bildern und Archetypen, die allen Menschen gemeinsam sind. Diese sprudelten oft an die Oberfläche des persönlichen Unbewussten. Träume könnten besser interpretiert werden, indem man die symbolischen Bezugspunkte universell geteilter Symbole versteht.
Freud glaubte, dass die Hauptantriebskraft hinter den Aktivitäten von Männern und Frauen die unterdrückte oder ausgedrückte Sexualität war. Unerfüllte Sexualität führte zu pathologischen Zuständen. Jung glaubte, dass Sex nur eines von vielen Dingen darstellt, die den Menschen antreiben. Noch wichtiger ist, dass Menschen von ihrem Bedürfnis angetrieben werden, Individuation, Ganzheit oder vollständige Selbsterkenntnis zu erreichen. Viele Emotionen treiben den Menschen dazu, sich auf psychisch ungesunde Weise zu verhalten, aber all diese Wege waren die Sehnsucht nach dem Wunsch, sich vollständig zu fühlen.
Das Unbewusste war für Freud der Speicher für alle unterdrückten sexuellen Wünsche, die zu pathologischen oder psychischen Erkrankungen führten. Nur durch die Freilegung des Unbewussten konnte ein Mensch entdecken, wie er glücklich leben und sich von psychischen Erkrankungen erholen kann. Jung hingegen war der Meinung, dass das Unbewusste oft von sich aus nach Ganzheit strebte und dass psychische Erkrankungen keine Pathologie, sondern eine unbewusste Regulation von Emotionen und gespeicherten Erfahrungen mit Tendenz zur Individuation seien.
Das Ziel des Therapeuten, so Jung, war es, der Person zu helfen, die Arbeit des Unbewussten zu erkennen, und so dem Patienten zu helfen, zu verstehen, wie er besser nach Individuation streben kann, die eine „ganze“ Person hervorbringen würde.
Während Freud zu einer sehr meisterhaften Art neigt, das Unbewusste zu stürmen, um es von verdrängten Gefühlen zu befreien, entspricht Jungs Weg eher den späteren humanistischen Psychologen. Es inspiriert die ganzheitliche Gestaltschule und später therapeutische Schulen.
Die Idee eines Unbewussten wird im Allgemeinen fast überall akzeptiert, doch weder Freud noch Jung hielten nach einer Erklärung eine weitere therapeutische Arbeit für notwendig. Spätere psychoanalytische Schulen wie diejenigen, die Verhaltensänderungen postulieren, haben sich bei der Behandlung psychischer Erkrankungen als erfolgreicher erwiesen. Sobald die zugrunde liegenden Gefühle verstanden sind, besteht die Arbeit darin, diese Gefühle zu negieren und durch positivere Gedanken zu ersetzen. Diese Arbeit wird von Freud und Jung ignoriert. Dennoch sind wir beiden Theoretikern für ihre Beiträge zur Psychiatrie zu Dank verpflichtet. Tatsächlich wird ihnen der Beginn der Psychiatrie zugeschrieben.