Ob in der Füllung oder darauf gestapelt, Fruchtkäsekuchen bietet Aromen, die die Frischkäsefüllung von Käsekuchen ergänzen. Kirschen, Limetten und Pfirsiche sind einige Optionen für die Herstellung von Fruchtkäsekuchen. Auch exotischere Früchte wie Mango, Ananas und Kokos werden für den Fruchtkäsekuchen verwendet. Käsekuchen kann auch Äpfel, Preiselbeeren und Erdbeeren enthalten.
Der Geschmack von Zitronen eignet sich gut für Käsekuchen, da viele Käsekuchenfüllungen bereits einen Hauch Zitronensaft enthalten. Zitronen-Cheesecake mit Beerensauce hat eine Mandel-Dattel-Kruste mit einer Füllung aus Cashewnüssen, Honig und Zitronensaft. Die Beerensauce wird aus Beeren hergestellt, die mit Datteln oder Honig vermischt und glatt gemixt werden. Zitronen-Käsekuchen enthält gesüßte Kondensmilch, Neufchatel-Käse und Eier. Es ist mit Vanille, Zitronensaft und Zitronenschale aromatisiert.
Äpfel können verwendet werden, um Fruchtkäsekuchen zuzubereiten, wie zum Beispiel Apfelstreusel-Käsekuchen, der Äpfel, braunen Zucker und Zimt enthält. Herbstlicher Apfelkäsekuchen mit einer Kruste aus Graham-Cracker-Krümeln, fein gehackten Pekannüssen und Zucker. Mit Zucker und Zimt überzogene Apfelscheiben werden über eine Frischkäse-Zucker-Füllung gelegt. Karamell-Apfel-Käsekuchen mit einer Kruste aus Graham-Cracker-Krümeln, gemahlenem Zimt und fein gehackten Pekannüssen. Die Frischkäsefüllung wird mit geschälten Äpfeln belegt und vor dem Servieren mit Karamell-Eis-Topping, Schlagsahne und gehackten Pekannüssen belegt.
Frische Kirschen und Dosenkirschen sind ein beliebtes Topping für Fruchtkäsekuchen. Einzelne Mini-Kirsch-Cheesecakes werden hergestellt, indem man eine Vanillewaffel auf den Boden einer Cupcake-Wrapper legt und dann die Frischkäsefüllung darüber gießt. Sie werden gekocht, abgekühlt und dann mit Dosenkirschkuchen gefüllt.
Mangos, Ananas und Pfirsiche können für die Herstellung von Fruchtkäsekuchen verwendet werden. Mango-Käse-Kuchen wird hergestellt, indem man Mango-Püree zu der Frischkäse-Füllung gibt. Pfirsichkäsekuchen wird aus Pfirsichgelatine und großen, reifen Pfirsichen hergestellt. Ananas-Käse-Kuchen wird aus fettfreiem Frischkäse, zerdrückter Ananas und zuckerfreiem Schlagobers hergestellt. Pina Colada Käsekuchen wird aus zerkleinerter Ananas, Kokoscreme und Sauerrahm hergestellt und mit leichtem Rum und Kokosnussextrakt aromatisiert.
Früchte mit etwas Biss, wie Preiselbeeren und Limetten, werden auch für die Herstellung von Fruchtkäsekuchen verwendet. Key Lime Cheesecake mit Erdbeerbuttersauce besteht aus Frischkäse, Eiern und Sauerrahm. Es ist mit Limettenschale, Erdbeeren und Limettensaft aromatisiert. Gewirbelter Cranberry-Käsekuchen verfügt über eine Kekskrume und eine Butterkruste. Die Frischkäsefüllung wird mit Vollbeeren-Preiselbeer-Sauce, Zimt und Nelke aromatisiert.