Nel campo della biologia, la traduzione del nick è un processo utilizzato per sostituire alcune molecole che compongono i filamenti di DNA con molecole simili che producono una caratteristica specifica e desiderata, spesso una caratteristica che consente a queste molecole di essere facilmente individuate e identificate durante un esperimento. Un enzima noto come DNA polimerasi I provoca la sostituzione di alcune molecole di DNA, note come nucleotidi, con nuovi nucleotidi. I nuovi nucleotidi vengono raccolti appositamente dagli scienziati che eseguono l’esperimento.
Spesso la traduzione del nick viene utilizzata per procedure scientifiche come il blotting. Ciò comporta l’isolamento e l’esame di ceppi di DNA per determinare in quali nucleotidi si tratta e quindi l’esecuzione di esperimenti sul particolare filamento di DNA. Conoscere diverse sequenze di DNA può aiutare a isolare una mutazione o creare un anticorpo per combattere un virus.
Il processo di traduzione del nick coinvolge i cosiddetti enzimi di restrizione usati per fare tagli o “nick” sulla sequenza del DNA. Un enzima di restrizione è progettato per tagliare una sequenza di DNA in una posizione specifica ed è un tipo di meccanismo di difesa utilizzato per distruggere i virus dannosi. Gli scienziati hanno messo l’enzima di restrizione al lavoro tagliando pezzi di DNA in modo da poterli sostituire con nuovi pezzi.
Una volta effettuate le intaccature, vengono utilizzati enzimi specifici per riparare il DNA con speciali nucleotidi studiati per facilitare lo studio del DNA. Gli scienziati studiano questa nuova sequenza di DNA per vedere come reagisce a se stessa o ad altri oggetti e avere questi nucleotidi etichettati semplifica il processo di monitoraggio e studio del filamento di DNA. Un esempio comune è l’inserimento di nucleotidi etichettati che si illuminano quando vengono posti sotto una luce nera, rendendoli così facili da individuare.
Un altro esempio comune di uno dei tanti usi della traduzione del nick è l’ibridazione fluorescente in situ. Questo processo consente a uno scienziato di cercare sequenze di DNA specifiche per vedere se sono presenti o meno in un filamento di DNA. La traduzione di Nick può dare a questi filamenti di DNA proprietà fluorescenti in modo che risplendano e lo scienziato può usarlo per aiutare a identificare quali sequenze di DNA sono presenti e quali sono assenti.
I nucleotidi rimossi e quindi sostituiti attraverso la traduzione del nick sono spesso definiti “DNA spazzatura”. Gli scienziati non sono ancora stati in grado di trovare alcuno scopo a cui servono queste molecole di DNA. Sembrano non funzionare e non portano il codice per alcun tipo di proteina, come è tipico della maggior parte del DNA utile.