A escolha dos sistemas de irrigação com efeito de estufa depende de vários fatores. Você precisa considerar o tamanho da sua estufa e os tipos de plantas que deseja cultivar. A fonte de água, a quantidade de água necessária e o tipo de fornecimento também devem ser levados em consideração. Você deve pensar sobre a freqüência com que estará disponível para regar as plantas sozinho ou se um sistema cronometrado ou sistema de auto-irrigação é o melhor para suas necessidades. Às vezes, uma combinação de diferentes sistemas de irrigação com efeito de estufa funcionará melhor para você.
Plantas diferentes precisam de quantidades diferentes de água. Cactos e suculentas precisam de muito pouca água, e rosas e ervas perenes como lavanda ou alecrim precisam apenas de uma quantidade moderada. Se suas plantas não precisam de muita água e sua estufa não é muito grande, uma viagem diária para a estufa com um regador será suficiente. Estufas maiores são mais fáceis de regar se houver uma torneira ou mangueira por perto, para que você não precise fazer várias viagens carregando o regador. Lembre-se de que, se você não puder regar as plantas regularmente ou se estiver saindo de férias longas, deve considerar sistemas de irrigação de estufa cronometrados ou com autogestão.
A maioria das flores e vegetais anuais, como tomate, pepino ou berinjela, precisa de um suprimento constante e diário de água para manter o solo úmido. Embora a estufa ajude a reter a umidade, essas plantas precisarão de sistemas de irrigação mais elaborados, caso você não consiga regá-las manualmente várias vezes ao dia. Muitas pessoas gostam de usar sistemas de gotejamento ou mangueiras de imersão porque usam menos água e distribuem a água diretamente no solo perto das raízes da planta, evitando mofo, crescimento de ervas daninhas e perda de água por evaporação. Algumas variedades de flores e plantas preferem água de cima, por isso, muitas vezes, um sistema de nebulização ou spray em um cronômetro é a melhor escolha.
Quer você opte por sistemas de irrigação por gotejamento ou por cima da estufa, a fonte de água é uma consideração importante. Para estufas menores perto de uma torneira, a pressão de uma mangueira geralmente é suficiente para manter o sistema funcionando. Estufas maiores podem exigir tubos maiores da fonte de água para fornecer água suficiente para fazer o sistema funcionar. Alguns sistemas de irrigação com efeito de estufa usam uma cisterna elevada ou um pequeno reservatório para o fornecimento de água. A cisterna ou reservatório pode ser enchido com água da chuva ou manualmente com mangueira, e a gravidade fará com que a água entre no sistema de rega, sendo necessário apenas reabastecer a cisterna regularmente.