Um aquecedor solar com efeito de estufa tem várias vantagens, bem como algumas desvantagens. Todo o calor necessário é fornecido pelo sol, que é um recurso limpo e renovável. Uma pessoa com um aquecedor solar com efeito de estufa normalmente terá contas de energia muito mais baixas do que alguém que tenha uma estufa aquecida por outros tipos de aquecedores. Por outro lado, pode não haver calor suficiente em dias nublados. Além disso, alguns equipamentos de estufa solar podem ser caros e pode ser difícil manter o interior de uma estufa solar em uma temperatura constante usando este tipo de aquecedor.
Uma das maiores vantagens de um aquecedor solar com efeito de estufa é que o sol é um recurso totalmente renovável. Alguns aquecedores de efeito estufa são movidos a gás natural, que é um recurso não renovável. Um aquecedor solar com efeito de estufa também é muito melhor para o meio ambiente porque a energia usada por esses aquecedores é limpa. Nenhum subproduto ou produto químico perigoso resulta do uso dos raios solares para aquecer uma estufa. Alguns combustíveis fósseis, por outro lado, freqüentemente resultam em subprodutos perigosos, como cancerígenos.
As estufas aquecidas a gás natural ou elétrica podem ser caras para manter. Com um aquecedor solar com efeito de estufa, por outro lado, uma pessoa geralmente não precisa se preocupar com uma conta alta de gás ou eletricidade. O sol é um recurso gratuito e ninguém é cobrado para usá-lo.
Um aquecedor a gás ou elétrico, entretanto, pode ser necessário para complementar um aquecedor solar com efeito de estufa como reserva. Uma das maiores desvantagens da energia solar é que nem sempre é totalmente confiável. Em dias nublados nos meses mais frios, por exemplo, o sol pode não fornecer calor suficiente para manter as plantas saudáveis.
Construir um aquecedor solar com efeito de estufa também pode custar um pouco mais do que comprar um sistema de lâmpada de calor tradicional. O fornecimento de estufa solar pode ser bastante caro. Se uma pessoa planeja usar painéis solares, isso também afetará o custo de construção de uma estufa solar, uma vez que geralmente são caros.
Regular a temperatura dentro de uma estufa com um aquecedor solar às vezes pode ser difícil. Durante os meses quentes, o interior dessas estufas pode ficar muito quente. Isso geralmente pode ser remediado, no entanto, abrindo uma porta ou janela.