A realização de testes genéticos pré-natais tem vários prós e contras. Do lado positivo, permite planejar possíveis problemas de desenvolvimento, determinar a viabilidade do feto e estabelecer a paternidade. Do lado negativo, isso acarreta o risco de prejudicar o feto e pode aumentar a probabilidade de aborto espontâneo. O teste genético também não é 100% preciso e pode causar problemas emocionais para a mulher ou o casal se eles forem confrontados com a decisão de interromper a gravidez.
O teste genético pré-natal pode fornecer aos pais as informações necessárias para o planejamento de quaisquer necessidades especiais que seu futuro filho possa ter. Pode determinar se defeitos congênitos, como lábio leporino ou espinha bífida, estão presentes, proporcionando aos pais tempo para planejar as opções de tratamento e possíveis cirurgias. Para problemas de desenvolvimento, como a síndrome de Down e outras trissomias, como a síndrome de Edward, o teste genético pré-natal dá aos pais tempo para se prepararem para a possibilidade de criar um filho com essa condição.
Na maioria das gestações, um feto incompatível com a vida abortará. Existem alguns casos, no entanto, em que a gravidez continua, independentemente do fato de que o feto quase certamente falecerá imediatamente após o nascimento. Nesses casos, o teste genético pré-natal pode ser útil para determinar se é seguro ou benéfico levar a gravidez até o fim, protegendo assim a saúde da mãe e protegendo o feto de dores desnecessárias.
Outro fator a favor do teste genético pré-natal é estabelecer a paternidade antes do nascimento da criança. Isso pode agilizar os arranjos de custódia e pensão alimentícia. O teste genético pode ser realizado com uma amniocentese relativamente no início da gravidez. O DNA coletado a partir desse teste pode ser comparado ao DNA de possíveis pais para determinar quem é legalmente responsável pela criança.
Possivelmente, um dos maiores contras do teste genético pré-natal é o impacto emocional que pode ter sobre os pais. Esse tipo de teste geralmente dá a elas a opção de continuar ou não a gravidez. Para alguns, isso pode ser considerado uma coisa boa. Pode, no entanto, aumentar as chances de trauma emocional ou culpa em termos de levar a termo ou decidir pelo término.
Embora os testes genéticos melhorem a cada ano, certos riscos ainda existem. Os dois testes genéticos mais comuns, vilosidade crônica e amniocentese, aumentam o risco de aborto espontâneo e, em alguns casos, podem causar danos ao feto. Este tipo de teste também nem sempre é preciso. Os fetos diagnosticados com certos problemas podem nascer perfeitamente saudáveis, e aqueles que se acredita serem saudáveis no útero podem não ser.