É difícil dar uma resposta exata à questão de saber se a ciprofloxacina é segura para crianças. Por um lado, os médicos prescrevem para crianças quando consideram necessário, e a maioria das crianças que o tomam o faz sem sentir quaisquer efeitos colaterais graves. O medicamento, entretanto, está associado a uma série de efeitos adversos que a maioria dos médicos prefere evitar em seus pacientes jovens. Como tal, o medicamento é geralmente considerado aceitável para o tratamento de infecções bacterianas graves, mas não é seguro o suficiente para tornar seu uso de rotina para infecções bacterianas comuns que uma criança pode desenvolver. Quando há outro medicamento com menos riscos que é considerado eficaz, os médicos são mais propensos a escolher a alternativa e guardar a ciprofloxacina para quando as alternativas são menos prováveis de funcionar.
Os médicos costumam ter cuidado ao prescrever ciprofloxacina para crianças devido ao fato de que a droga tem uma série de efeitos colaterais graves associados a ela, alguns dos quais podem representar um risco maior para crianças do que para adultos. Os médicos normalmente reservam seu uso para situações em que os benefícios superam os riscos de usá-lo ou para quando não há outros medicamentos que possam ser eficazes contra a bactéria. Por exemplo, um médico pode estar mais propenso a prescrevê-lo quando uma criança tem uma infecção potencialmente fatal do que quando ela tem uma infecção de ouvido básica.
Entre os efeitos colaterais que tornam os médicos cautelosos quanto ao uso de ciprofloxacina em crianças estão: alterações nas células sanguíneas; distúrbios visuais; e doenças que afetam órgãos vitais, incluindo o fígado ou os rins. Alterações na frequência cardíaca, redução da pressão arterial, tonturas e desmaios e sensibilidades à luz também podem resultar do uso deste medicamento. Até mesmo problemas como tremores, alucinações e episódios psicóticos foram relatados. Esses efeitos colaterais graves são relativamente raros, mas são preocupantes o suficiente para dar uma pausa ao considerar a prescrição de ciprofloxacina para crianças.
Nem todos os efeitos colaterais da ciprofloxacina são graves. Existem também muitos efeitos colaterais relativamente menores que a medicação pode causar em crianças, pois às vezes elas são mais vulneráveis aos efeitos da medicação do que os adultos. Eles incluem náuseas, vômitos e diarreia, bem como dores de cabeça, erupções cutâneas, perda de apetite, ansiedade e fadiga. Alguns pacientes podem até desenvolver dores nas articulações e infecções fúngicas em relação ao uso de ciprofloxacina em crianças. Os médicos podem preferir prescrever um medicamento alternativo para evitar esses efeitos colaterais.