La maggior parte dei kit di isolamento dell’acido ribonucleico (RNA) è in grado di isolare RNA di alta qualità da un’ampia gamma di tessuti e tipi di organismi, tra cui piante, animali e virus. L’RNA mitocondriale e ribosomiale – rispettivamente mRNA e rRNA – può richiedere kit di isolamento dell’RNA specializzati specifici per piccoli filamenti di RNA. Altri fattori che possono differire tra i vari kit di isolamento sono la quantità di campioni che ciascun kit può elaborare e il tempo necessario per elaborare completamente un campione.
I tipi più comuni di kit di isolamento dell’RNA possono essere utilizzati per un’ampia varietà di applicazioni, indipendentemente dalla provenienza dell’RNA. Le cellule e i tessuti dei mammiferi sono tra le fonti più utilizzate per l’isolamento e la purificazione dell’RNA. Cellule vegetali e virus sono utilizzati anche in esperimenti di biologia molecolare che richiedono l’uso di un kit di isolamento dell’RNA.
Una volta che il tessuto o il campione di sangue è stato raccolto, deve essere preparato per l’isolamento dell’RNA durante un processo critico noto come degradazione, separazione o distruzione cellulare. Se il materiale cellulare non viene completamente distrutto, il processo di isolamento dell’RNA produrrà meno RNA. I migliori kit di isolamento dell’RNA includono materiali e forniture per la degradazione cellulare prima dell’isolamento e la purificazione dell’RNA dopo l’isolamento.
In casi speciali in cui un esperimento richiede mRNA o rRNA, sono disponibili kit di isolamento dell’RNA specializzati per filamenti di RNA particolarmente piccoli. I materiali e le forniture inclusi in tale kit possono essere diversi in termini di quantità e dimensioni. Questi kit di isolamento dell’RNA sono meno comuni dei kit di RNA multiuso e potrebbe esserci una sostanziale differenza di costo.
Molti comuni kit di isolamento dell’RNA sono progettati per l’uso con tutti i tipi di tessuti e cellule e possono completare una reazione entro circa 20 minuti. Il tempo necessario per la completa degradazione cellulare può variare a seconda di dove nell’organismo sono state raccolte le cellule. Oltre alla fase di degradazione cellulare, il processo di isolamento dell’RNA e la successiva purificazione sono relativamente standard in termini di procedura e tempo.
Un’altra caratteristica che può essere specifica di alcuni kit è la quantità di campione necessaria per elaborare la reazione. Mentre alcuni kit di isolamento possono richiedere un volume di campione relativamente grande, altri kit possono funzionare bene con un volume inferiore. Questa differenza può essere un vantaggio se il volume del campione è un fattore limitante.
Diversi produttori di kit di isolamento dell’RNA hanno tabelle di confronto disponibili su Internet. Questi grafici possono essere utilizzati per vedere le differenze tra i vari kit che producono. Le differenze possono includere tipi di applicazioni specializzate, prodotti chimici e volumi di campione richiesti.