Si bien el uso del transporte público puede ser una excelente manera de ahorrar dinero mientras viaja, también tiene varias desventajas que los viajeros deben conocer. Estos incluyen posibles amenazas a la seguridad personal, irregularidades en la programación y el hecho de que, en algunas comunidades, el transporte público tiene una cobertura limitada y está disponible durante horas limitadas. Los viajeros que planean depender del transporte público deben tomarse el tiempo para familiarizarse con los sistemas disponibles en los lugares que visitan para evitar dificultades y peligros. La investigación previa al viaje es particularmente importante para quienes tienen discapacidades, ya que algunos sistemas de transporte público son menos adaptables que otros.
Una consideración primordial de los viajeros debería ser si realmente pueden llegar a los lugares que desean visitar a través del transporte público. En algunas comunidades, las rutas pueden ser muy limitadas, lo que puede ser una gran desventaja para los viajeros que no tienen un medio alternativo para moverse. Si un viajero visita un lugar donde las principales atracciones u opciones de alojamiento no están cerca de las rutas de transporte público, es posible que deba consultar sobre los servicios de transporte privado, como los taxis. Otra consideración es que los servicios de transporte público no siempre operan durante la noche, los días festivos o los fines de semana. Nuevamente, si un viajero se hospeda en un área relativamente remota, esto puede causar dificultades significativas a menos que el viajero pueda asegurarse un transporte privado.
Para muchos viajeros, la desventaja más significativa del transporte público es la posibilidad de ser atacados o robados. En situaciones en las que los viajeros no están familiarizados con las costumbres o el idioma de un lugar en particular, pueden ser particularmente vulnerables a ser atacados por delincuentes. Los turistas pueden querer hablar con guías locales o empleados del hotel sobre la seguridad de las diferentes opciones de transporte público.
Si bien es menos grave que los déficits en la cobertura o el problema del crimen, la falta de confiabilidad de algunos sistemas sigue siendo una de las desventajas más importantes del transporte público. Varios tipos de transporte público están sujetos a mal funcionamiento de los equipos, así como a interrupciones del servicio causadas por emergencias e incluso huelgas laborales. Estas interrupciones pueden crear problemas para los turistas que han planificado cuidadosamente sus actividades diarias, solo para descubrir que se retrasan significativamente debido a la construcción de vías o un vehículo averiado. En algunos casos, los viajeros pueden evitar rutas que tienen problemas al verificar el estado de varias líneas de tren y rutas de autobús en las estaciones o en línea.