O caminho espiritual Siddha Yoga é essencialmente baseado na filosofia de que o foco no eu interior pode trazer alguém para mais perto de Deus. É fortemente inspirado no Shaivismo da Caxemira e nas tradições espirituais hindus do Vedanta. O Siddha Yoga é apresentado por seus praticantes como uma espiritualidade individual que freqüentemente é desenvolvida em uma comunidade de crentes. Dependendo da percepção individual da organização, é normalmente referido como um novo movimento religioso ou um culto.
Siddha Yoga é uma combinação de prática diária e ensinamentos transmitidos por um guru. Os ensinamentos incluem instruções sobre as filosofias básicas de autodescoberta, serviço aos outros e adesão às tradições das escrituras da religião hindu. A prática inclui meditação, canto e ouvir música sacra. Essas atividades são normalmente realizadas em centros de meditação e em retiros, embora algumas atividades diárias também possam ser praticadas em casa.
Um estudante novo em Siddha Yoga geralmente será iniciado espiritualmente com uma prática conhecida como shaktipat diksha. Este é um processo pelo qual o guru dá as boas-vindas a um aluno disposto com um gesto simbólico, como um toque, mantra ou palavra sagrada. Desta forma, acredita-se que o guru penetrou e entrou no espírito do aluno. Alguns seguidores do método descreveram esse processo como a aura do guru envolvendo o aluno.
Swami Muktananda Paramahamsa fundou o Siddha Yoga na Índia, sob a orientação de seu professor espiritual Bhagawan Nityananda. Ele finalmente abriu vários centros de meditação em todo o mundo. Houve centros no Japão, Estados Unidos, Grã-Bretanha, Austrália e França, entre muitas outras nações. O movimento tende a se concentrar nos maiores ashrams de Nova York e Ganeshpuri, na Índia. Após a morte de Swami Muktananda em 1982, seu discípulo Gurumavi Chidvilasanada, que era originalmente conhecido como Malti Shetty, assumiu a liderança espiritual do movimento Siddha Yoga.
Tem havido controvérsia sobre as ações de alguns gurus de Siddha Yoga e do movimento em geral. William Rodarmor em 1983 e Lis Harris em 1994 levantaram dúvidas sobre a prática em vários artigos publicados. Desde 1996, o site Leaving Siddha Yoga também manteve uma voz altamente crítica sobre o movimento e seus líderes. As alegações contra o movimento incluem abuso sexual, controle da mente e lutas internas perturbadoras e inadequadas entre os gurus e seus associados. Também tem havido perfis principalmente positivos do movimento em artigos em várias revistas populares.