Muffins de baixa caloria podem ser comprados comercialmente ou preparados em casa. Os diferentes tipos de sabores incluem farelo, frutas, vegetais e chocolate. Tipos de baixas calorias salgados, em vez de doces, incluem fubá e muffins ingleses. Cortar a gordura e o açúcar nas receitas de muffin pode criar opções de baixas calorias. Leite desnatado, óleo em vez de manteiga e clara de ovo em vez de ovos inteiros são maneiras de reduzir as gorduras, enquanto a substituição de um pouco do açúcar pela compota de maçã também pode diminuir a contagem de calorias.
Frutas como bananas e frutas vermelhas são adições populares às receitas de muffins elaboradas para serem de baixa caloria. Legumes como abobrinha ou batata doce também podem ser usados para assar alimentos com baixas calorias. Variedades mais doces, como aquelas que contêm chocolate, também podem ser adequadas se as calorias forem controladas. Em vez de raspas de chocolate ou chocolate de cozimento adoçado, variedades com baixo teor de açúcar ou mesmo sem açúcar costumam ser usadas em muffins de baixa caloria. Além disso, o uso de compota de maçã não só pode substituir um pouco do açúcar para cortar calorias, mas também pode trazer à tona o sabor do chocolate.
Batata doce e abobrinha usadas em muffins podem adicionar sabor e vitaminas sem muitas calorias. Nestes muffins vegetais de baixa caloria, a canela pode ser um grande adoçante, o que pode reduzir a quantidade de açúcar necessária. Alguns padeiros gostam de adicionar outras especiarias saborosas aos muffins de abobrinha ou de batata-doce, como gengibre e noz-moscada. Como o açúcar mascavo tem um sabor mais rico do que a variedade branca, menos adoçante pode ser necessário.
Muffins de mirtilo com baixo teor de gordura são um dos tipos mais comuns disponíveis. Podem ser feitos com farinha branca, que pode ser de baixa caloria, mas não oferece a nutrição de grãos inteiros como muffins de trigo ou farelo. Morango e framboesa são outras opções de muffins de baixa caloria à base de frutas. Alguns cozinheiros gostam de fazer um recheio dessas frutas colocando um pouco da massa de fubá parcialmente nas formas de muffins, adicionando a fruta e cobrindo com mais massa.
Muffins de fubá de baixa caloria também podem ser saborosos, recheados com molho em vez de frutas. Esses tipos de muffins de baixa caloria podem ser servidos com um prato, como ensopado ou sopa. Normalmente, muffins saborosos de farinha de milho não requerem muito açúcar e pode-se usar óleo em vez de manteiga. Os muffins ingleses também não costumam ser muito doces, mas diferem dos outros muffins de baixa caloria porque não são assados no forno, mas sim em uma frigideira. Os anéis de metal são colocados em uma chapa aquecida antes de adicionar a massa do muffin inglês.