Während viele Läufer die Vorteile des Barfußlaufens sofort spüren, sind andere Läufer möglicherweise nicht davon überzeugt, dass das Training sicher oder vorteilhaft ist, weshalb die Debatte tendenziell weitergeht. Einige Studien kamen zu dem Schluss, dass die Vorteile des Barfußlaufens eine geringere Belastung der Füße und Beine beinhalten, während andere sagen, dass die Vorteile vernachlässigbar oder sogar nicht vorhanden sind. Der Fuß neigt dazu, sich beim Barfußlaufen natürlicher zu bewegen als beim Laufen in einem gepolsterten Schuh, was das Risiko von Weichteilverletzungen oder sogar Frakturen im Fuß verringern kann.
Der vielleicht bedeutendste Vorteil des Barfußlaufens ist die geringere Belastung durch Barfußläufer. Menschen, die in gepolsterten Schuhen laufen, neigen dazu, während des Laufschritts mit der Ferse zuerst zu landen, was bedeutet, dass eine erhebliche Kraft auf die Füße und Beine übertragen wird. Barfußläufer landen hingegen eher auf den Fußballen, was den Aufprall besser abfedert und die gleiche Kraftübertragung auf Füße und Beine verhindert. Die Vorteile des Barfußlaufens bedeuten in diesem Fall ein geringeres Verletzungsrisiko und ein geringeres Auftreten von vorzeitiger Ermüdung.
Das Laufen mit gepolsterten Turnschuhen kann den Fuß tatsächlich schwächen, indem es im Fußgewölbe und in der Ferse übermäßigen Halt bietet. Ein schwächerer Fuß bedeutet eine höhere Verletzungsgefahr, insbesondere im Fuß- und Knöchelbereich. Einer der Vorteile des Barfußlaufens ist die Fähigkeit, die im gesamten Fuß vorhandenen Muskeln, Sehnen, Bänder und sogar Knorpel zu stärken, was die Verletzungsgefahr verringert und die Mobilität und Stabilität der Füße und Beine erhöhen kann. Der Übergang zwischen Laufen mit Schuhen und Barfußlaufen sollte jedoch behutsam und schrittweise erfolgen, da sich der geschwächte Fuß nicht an die neue Umgebung gewöhnt. Möglicherweise muss der Gang des Läufers angepasst werden, damit er beim Laufen auf den Fußballen landet und nicht auf den Fersen.
Ein potenzieller Nachteil des Barfußlaufens ist die Witterungseinflüsse sowie unebenes oder unbequemes Gelände. Auch nachdem sich Schwielen an den Füßen entwickelt haben, besteht die Gefahr, dass der Läufer durch auf dem Boden verstreuten Schmutz Stichwunden bekommt, was wiederum zu Infektionen wie Tetanus führen kann. Das Laufen über verschiedene Arten von Trümmern kann für einige Läufer auch unangenehm sein, und es besteht ein höheres Risiko für andere Verletzungen, wie z. B. gestoßene Zehen, die zu Frakturen führen können. Spezielle nicht gepolsterte Schuhe mit individuellen Schlitzen für die Zehen wurden entwickelt, um eine natürliche Bewegung des Fußes zu ermöglichen und gleichzeitig einen gewissen Schutz vor Schmutz zu bieten.