Elegir el motor de bote externo adecuado requiere una cuidadosa consideración de muchos factores. El tamaño del barco y su uso previsto son quizás los dos más importantes. Otras consideraciones al elegir un motor incluyen el tipo de agua en el que se utilizará el barco, así como la experiencia del propietario del barco; Los propietarios de embarcaciones sin experiencia deben elegir un motor fueraborda que no sea tan potente como el que utilizan los operadores de embarcaciones experimentados. El diseño del motor también puede ser un factor determinante ya que algunos diseños no se ofrecen en todos los tamaños.
Colocar un motor fuera de borda en un bote que sea demasiado grande para él puede ocasionar muchos problemas. Una de las más notables es la incapacidad del barco para subir en avión. Un motor pequeño no puede generar la velocidad para permitir que un bote grande se levante del agua. Esto también puede ser un problema de seguridad, ya que es posible que el motor no pueda empujar un bote grande contra una corriente fuerte. Esto puede llevar a que un bote esté fuera de control y a merced del viento y la corriente.
Por otro lado, si el motor de un bote fuera de borda utilizado en una embarcación destinada a curricán de baja velocidad es demasiado grande, el motor puede sufrir la operación continua de baja velocidad. Las bujías sucias y el sobrecalentamiento a menudo ocurren cuando un motor grande funciona a velocidades extremadamente lentas durante largos períodos de tiempo. Otra opción a considerar incluye la opción de motor de 2 tiempos o 4 tiempos. A menudo, un motor de 4 tiempos funcionará a velocidades más lentas mucho mejor que un motor de 2 tiempos. Este último sufrirá tapones sucios de aceite cuando no se le dé la oportunidad de limpiarse con una carrera de alta velocidad.
Con la tremenda producción de energía del motor fuera de borda más grande, a menudo es aconsejable que el propietario de la embarcación sin experiencia elija uno más pequeño y menos potente. Empujar un motor grande a su nivel superior de rendimiento a menudo puede abrumar a un navegante sin experiencia y conducir al desastre. Una embarcación que se mueve a la máxima velocidad se ve fácilmente afectada por el movimiento más pequeño de los controles. Comenzar con un motor más pequeño es un método productivo para ganar experiencia. Una vez dominado, el motor fueraborda más pequeño puede cambiarse en un modelo más grande o usarse en un bote de respaldo diferente.