Dado que el pescado se considera una carne extremadamente saludable y beneficiosa, se alienta a muchos consumidores a que formen una parte más importante de su dieta. El aumento de la demanda de pescado ha llevado a la sobrepesca en muchas poblaciones de peces silvestres. En respuesta, se han establecido granjas de peces, criando peces en áreas cerradas y enrejadas. El pescado de cultivo podría verse como una respuesta sostenible a la sobrepesca, pero desafortunadamente, el pescado de cultivo puede no ser tan ecológico como parece. Existe un debate mundial sobre el pescado de piscifactoría, lo que dificulta a los consumidores tomar decisiones que sean beneficiosas para el pescado y al mismo tiempo incluirlo en sus dietas.
Existen numerosos problemas con los peces de cultivo que los convierten en una mala elección dietética, con la excepción de ciertas especies de peces y mariscos. Los mariscos como las ostras, por ejemplo, se han cultivado con éxito durante décadas, y el cultivo de ostras en realidad parece beneficiar al medio marino. Ciertas especies como la tilapia, el esturión y el bagre se crían a menudo de forma sostenible y respetuosa con el medio ambiente.
Sin embargo, las personas deben evitar comprar la mayoría de las otras especies de peces de cultivo. La primera preocupación es con la salud humana. Los peces de cultivo son alimentados con una dieta barata y estandarizada. Esto lleva a una variación nutricional mucho menor de la que recibirían en la naturaleza, lo que crea menos valor nutricional, por libra, que los peces salvajes. La dieta alimentada al pescado de piscifactoría también es rica en grasas, y la grasa concentra toxinas dañinas como los PCB.
La salud de la pesca también es una preocupación importante con los peces de cultivo. Muchos peces de cultivo se alimentan con peces de las pesquerías sudamericanas, que se están agotando rápidamente como resultado. Además, las especies no nativas que se cultivan pueden escapar, en detrimento de las especies nativas de la región. Los peces de cultivo también transmiten enfermedades y parásitos, ya que se mantienen en corrales apretados. Mientras que los peces de piscifactoría están cargados de antibióticos, los peces salvajes de la región no, y pueden enfermarse y lo hacen.
El medio marino también se ve muy afectado por los peces de cultivo. La mayoría de los peces son comedores relativamente ineficientes, dejan caer la mayoría de sus alimentos al fondo del océano y solo digieren un pequeño porcentaje de lo que comen. Cuando los peces se mantienen en un entorno fijo, esto conduce a la eutrofización, un aumento concentrado de nutrientes que finalmente conduce a una zona muerta. Los peces de cultivo también crean otros tipos de contaminación, que pueden ser difíciles de eliminar, incluso después de que los peces de cultivo se eliminan de la región.
La búsqueda de peces silvestres como el atún blanco, el atún aleta amarilla, las anchoas, el pescado azul, el bacalao del Pacífico, el cangrejo de río, el halibut, las sardinas, el hoki, el mahi-mahi y la caballa es una excelente manera de apoyar la pesca sostenible y las prácticas de pesca. Siempre se deben evitar los peces como el mero, el áspero anaranjado, la lubina chilena, los tiburones, el atún rojo, el pez espada y las especies de arrastre o dragado, ya que muchas de estas pesquerías están severamente agotadas. La pesca de arrastre y el dragado también son muy malos para el medio marino. La langosta, el cangrejo, el lenguado y el pargo se consideran aceptables para comer, aunque las pesquerías están en riesgo y los consumidores pueden evitarlas.