Einige Frauen nehmen Ondansetron während der Schwangerschaft ein, um die morgendliche Übelkeit zu kontrollieren. Von der US-amerikanischen Food and Drug Administration (FDA) als Medikament der Schwangerschaftskategorie B eingestuft, gilt es im Allgemeinen als sicher zur Linderung von Übelkeit in der Schwangerschaft. Es sollte jedoch nur bei Bedarf eingenommen werden, beispielsweise wenn die Frau wegen extremer Übelkeit keine Nahrung bei sich behalten kann. In solchen Fällen werden alle möglichen negativen Auswirkungen von Ondansetron in der Regel als besser angesehen als der Schaden, der dem Fötus entstehen kann, wenn er nicht die entsprechenden Nährstoffe von der Mutter erhält. Aus diesem Grund wird schwangeren Frauen empfohlen, die Vor- und Nachteile mit ihrem Arzt zu besprechen, bevor sie dieses Medikament einnehmen.
Ondansetron wird als Arzneimittel der Schwangerschaftskategorie B eingestuft, da bis 2011 keine kontrollierten Studien mit schwangeren Frauen abgeschlossen wurden. Forscher haben jedoch Studien an Tieren durchgeführt, um die Auswirkungen von Ondansetron in der Schwangerschaft herauszufinden. Den Ergebnissen zufolge hat dieses Medikament keine schädlichen Auswirkungen auf Tierföten verursacht. Allerdings reagieren Tiere nicht immer so auf Medikamente wie Menschen, weshalb es schwierig ist, mit Sicherheit zu sagen, dass Ondansetron in der Schwangerschaft dem Fötus nicht schadet. Vor diesem Hintergrund werden Ärzte dieses Medikament nicht anbieten, es sei denn, sie sind sich sicher, dass ihre schwangeren Patienten es aus gesundheitlichen Gründen benötigen.
Der Hauptgrund, warum viele Ärzte trotz fehlender Studien am Menschen immer noch Ondansetron verschreiben, ist, dass die geringe Wahrscheinlichkeit negativer Auswirkungen oft besser ist als die Alternative. Manche Frauen leiden beispielsweise während der Schwangerschaft an Hyperemesis gravidarum, was bedeutet, dass sie fast alles, was sie essen, erbrechen können. Frauen, die von dieser Erkrankung betroffen sind, können normalerweise auch keine Flüssigkeiten bei sich behalten, was die Gefahr einer Dehydration birgt. Dies, kombiniert mit dem Mangel an Nährstoffen, der durch das Erbrechen der meisten Nahrungsmittel verursacht wird, kann sowohl der Mutter als auch dem Fötus ernsthaft schaden. Dehydration und Unterernährung sind beide dafür bekannt, schädlich zu sein, während Ondansetron in der Schwangerschaft keine bekannten schädlichen Wirkungen hat, so dass die Einnahme von letzterem normalerweise als die beste Option angesehen wird.
Die meisten Frauen, die Ondansetron während der Schwangerschaft einnehmen, benötigen es nur im ersten Trimester, wenn sie am ehesten an morgendlicher Übelkeit leiden. Manche Frauen benötigen es jedoch während der gesamten Schwangerschaft. In solchen Fällen wird ihr Arzt die Situation wahrscheinlich bei jedem vorgeburtlichen Termin neu bewerten, um festzustellen, ob der Nutzen von Ondansetron in der Schwangerschaft die möglichen Risiken noch überwiegt. Die meisten Frauen brauchen dieses Medikament nach Beendigung der Schwangerschaft nicht mehr, was für stillende Mütter wahrscheinlich eine gute Sache ist, da nicht bekannt ist, ob das Arzneimittel in die Muttermilch übergeht.