La plupart des kits d’isolement d’acide ribonucléique (ARN) peuvent isoler de l’ARN de haute qualité à partir d’un large éventail de tissus et de types d’organismes, y compris les plantes, les animaux et les virus. L’ARN mitochondrial et ribosomique – ARNm et ARNr, respectivement – peut nécessiter des kits d’isolement d’ARN spécialisés spécifiques aux petits brins d’ARN. D’autres facteurs qui peuvent différer entre les divers kits d’isolement sont la quantité d’échantillons que chaque kit peut traiter et le temps nécessaire pour traiter complètement un échantillon.
Les types les plus courants de kits d’isolement d’ARN peuvent être utilisés pour une grande variété d’applications, quelle que soit la provenance de l’ARN. Les cellules et tissus de mammifères sont parmi les sources les plus prédominantes utilisées pour l’isolement et la purification de l’ARN. Les cellules végétales et les virus sont également utilisés dans des expériences de biologie moléculaire qui nécessitent l’utilisation d’un kit d’isolement d’ARN.
Une fois que l’échantillon de tissu ou de sang est collecté, il doit être préparé pour l’isolement de l’ARN au cours d’un processus critique connu sous le nom de dégradation, séparation ou rupture cellulaire. Si le matériel cellulaire n’est pas complètement perturbé, le processus d’isolement de l’ARN produira moins d’ARN. Les meilleurs kits d’isolement d’ARN comprennent du matériel et des fournitures pour la dégradation cellulaire avant l’isolement et la purification de l’ARN après l’isolement.
Dans les cas particuliers où une expérience nécessite un ARNm ou un ARNr, des kits d’isolement d’ARN spécialisés sont disponibles pour les brins d’ARN particulièrement petits. Les matériaux et fournitures inclus dans un tel kit peuvent être différents en termes de quantité et de taille. Ces kits d’isolement d’ARN sont moins courants que les kits d’ARN polyvalents, et il peut y avoir une différence de coût substantielle.
De nombreux kits d’isolement d’ARN courants sont conçus pour être utilisés avec tous les types de tissus et de cellules et peuvent achever une réaction en 20 minutes environ. Le temps nécessaire à la dégradation cellulaire complète peut varier en fonction de l’endroit de l’organisme où les cellules ont été collectées. Au-delà de l’étape de dégradation cellulaire, le processus d’isolement de l’ARN et la purification ultérieure sont relativement standard en termes de procédure et de temps.
Une autre caractéristique qui peut être spécifique à certains kits est la quantité d’échantillon nécessaire pour traiter la réaction. Alors que certains kits d’isolement peuvent nécessiter un volume d’échantillon relativement important, d’autres kits peuvent bien fonctionner avec un volume inférieur. Cette différence peut être un avantage si le volume de l’échantillon est un facteur limitant.
Plusieurs fabricants de kits d’isolement d’ARN ont des tableaux de comparaison disponibles sur Internet. Ces tableaux peuvent être utilisés pour voir les différences entre les différents kits qu’ils produisent. Les différences peuvent inclure des types d’applications spécialisées, des produits chimiques et des volumes d’échantillons requis.