Lissamphibia ist die einzige überlebende Unterklasse der Amphibien – die anderen beiden, Lepospondyli (Lepospondyle) und Labyrinthodontia (Labyrinthodonten), die im Perm (vor 290 Millionen Jahren) bzw. in der Kreidezeit (120 Millionen Jahre) ausgestorben sind. Labyrinthodonten gingen bereits durch das Aussterben der Perm-Trias (251 Mio. Lissamphibia besteht aus drei Ordnungen: Frösche/Kröten, Salamander und die gliederlosen Caecilans.
Die frühesten bekannten Mitglieder der Unterklasse Amphibien sind basale Temnospondylen, die vor 340 Millionen Jahren im Unterkarbon datiert wurden. Diese fischähnlichen Tetrapoden hatten ausladende Haltungen, die sie nahe am Boden hielten, und waren relativ groß, 3 bis 5 Fuß lang, wie die Lappenflossenfische, aus denen sie sich entwickelten. Sie verbrauchten beim Gehen so viel Energie, dass sie oft erschöpft gewesen wären und sich ausruhen mussten. Da sich fleischfressende Tetrapoden noch nicht entwickelt hatten, konnten sie zum Glück für eine Weile in Frieden ruhen.
Das erste bekannte Mitglied von Lissamphibia, „Hotton’s Ancient Frog“, auch bekannt als „Frogamander“, wird vor 290 Millionen Jahren in das Frühe Perm datiert. Wie der Name schon sagt, hat es eine Kombination aus Salamander- und Frosch-ähnlichen Eigenschaften. Obwohl dies bekannt ist, sind die Wissenschaftler jedoch relativ verwirrt über die Details der Herkunft und die Beziehung zwischen den Gruppen in Lissabon.
Jede mögliche Abstammung wurde vorgeschlagen – dass Lissamphibia eine Klade innerhalb von Temnospondylen (eine häufig vorkommende Art von Labyrinthodont) ist, eine Klade innerhalb von Lepospondylen, oder dass Caecilans ihren Ursprung in Lepospondylen haben und Frösche und Salamander ihren Ursprung in Temnospondylen haben. Aufgrund der großen Anzahl gemeinsamer Merkmale aller Mitglieder von Lissamphibia erkennen die meisten Wissenschaftler an, dass es sich um eine natürliche Klade handelt, was die letzte Möglichkeit am wenigsten wahrscheinlich macht. Einige Wissenschaftler neigen zu der Annahme, dass sich Lissamphibien aus Temnospondylen entwickelt haben, da sie während der fraglichen Zeit (dem Karbon) vielfältiger und zahlreicher waren als Leposondylen. Lepospondyle waren jedoch erheblich kleiner, so dass es sinnvoll sein könnte, dass sich eine Gruppe kleiner Amphibien aus einer anderen Gruppe kleiner Amphibien entwickelt und nicht aus einer im Durchschnitt deutlich größeren Gruppe.
Aufgrund einer Periode im Fossilienbestand, in der nur wenige Tetrapodenfossilien gefunden wurden, bekannt als „Romer’s Gap“ (360-340 Mio. Jahren), ist die Herkunft der Tetrapoden etwas mysteriös. Vor kurzem wurden jedoch neue Fossilienfundstellen mit Exemplaren aus dieser schwer fassbaren Zeit gefunden. Wir haben eine Menge Dinge über diese verschwommene Periode der alten Evolutionsgeschichte zu lernen.