Chromosomen-Walking ist eine Methode des positionellen Klonens, die verwendet wird, um ein bestimmtes Allel in einer Genbibliothek zu finden, zu isolieren und zu klonen. Ein Allel ist ein Gen für ein bestimmtes genetisches Merkmal, das von Erwachsenen an ihre Nachkommen weitergegeben wird, beispielsweise das Allel für braune Augen in einem Gen für die Augenfarbe. Manchmal kann die ungefähre Position eines einzelnen Allels in einer Kette von Desoxyribonukleinsäure (DNA) bekannt sein. Um ein bestimmtes Allel für eine genetisch übertragbare Krankheit zu isolieren, muss das Chromosomen-Walking möglicherweise in einer nicht kartierten DNA-Sequenz außerhalb der zuvor kartierten Sequenzen nach der gewünschten Probe suchen.
Um ein bestimmtes Krankheitsgen zu lokalisieren, beginnt das Gehen beim nächsten bereits identifizierten Gen, dem sogenannten Markergen. Jedes nachfolgende Gen in der Sequenz wird wiederholt auf sogenannte Überlappungsbeschränkungen getestet und auf ihre genaue Lage in der Sequenz kartiert. Schließlich erreicht das Gehen durch die Gene das mutierte Gen in einer nicht kartierten Sequenz, die an ein Fragment eines Gens dieser bestimmten Krankheit bindet. Sobald das Gen kloniert ist, kann seine Funktion vollständig identifiziert werden. Während dieses Prozesses werden Tests durchgeführt, um die Eigenschaften jedes nachfolgenden Klons vollständig zu identifizieren und ihre Standorte für die zukünftige Verwendung abzubilden.
Es gibt fast ein halbes Dutzend positioneller Klonierungstests, die vor einem Chromosomen-Walking durchgeführt werden, um die bestimmten genetischen Sequenzen, die das gewünschte mutierte Gen für eine Krankheit enthalten könnten, so weit wie möglich einzugrenzen. Sobald die Marker auf beiden Seiten einer nicht kartierten wahrscheinlichen Sequenz gefunden wurden, kann die Chromosomenwanderung von einem der Marker aus beginnen. Die Tests an jedem nachfolgenden Klon sind komplex, zeitaufwändig und je nach Spezies unterschiedlich. Es gibt andere Tests für Gene, die mit Pflanzenkrankheiten in Verbindung stehen, als für Gene, die an einer menschlichen Genbibliothek beteiligt sind.
Beim positionellen Klonen werden genetische Marker verwendet, von denen bekannt ist, dass sie die Chromosomen von Personen mit bestimmten Krankheiten bewohnen. Diese Datenbanken bekannter gemeinsamer Merkmale ermöglichen Tests, mit denen Personen identifiziert werden können, die möglicherweise bestimmte rezessive Gene für eine noch nicht aufgetretene Krankheit aufweisen oder nicht. Chromosomen-Walking erfordert zusammen mit allen anderen Tests, die vor dem Chromosomen-Walking durchgeführt werden, außergewöhnlich gut ausgestattete Labors, in denen alle Klonierungsphasen, Untersuchungen und Analysen der gefundenen Mutationen durchgeführt werden können.