Das Molekulargewicht des Peptids ist eine Zahl ohne Einheiten, die sich aus dem Verhältnis einer durchschnittlichen Masse eines Peptidmoleküls geteilt durch ein Zwölftel der Masse eines Kohlenstoffatoms 12 ergibt. Das Molekulargewicht des Peptids kann auch als ein Mol des Peptids beschrieben werden in Gramm, als Mol ist eine Menge des Peptids, die seinem Molekulargewicht entspricht. Da das Aminosäuregewicht von Prolin beispielsweise 97.12 beträgt, entspricht ein Mol Prolin 97.12 Gramm der Substanz.
Es ist wichtig, die Molekulargewichtszahlen von Peptiden in Prozessen wie der Peptidsynthese zu kennen, da das Gewicht verwendet werden kann, um die Konzentration von molekularen Komponenten zu bestimmen. Hätte beispielsweise eine Komponente ein Molekulargewicht von 50 und eine andere ein Molekulargewicht von 100, dann würden die Moleküle in der zweiten Verbindung doppelt so viel wiegen wie die in der ersten Verbindung. Wenn beide zu gleichen Gramm kombiniert würden, hätte die Verbindung mit dem geringeren Gewicht doppelt so viele Moleküle in der Mischung, da sie nur die Hälfte wogen, und anstelle einer 50/50-Konzentration würde eine Konzentration von etwa 66 vorliegen /33.
Molekulargewichtsanalysesoftware wird häufig verwendet, um die Molekulargewichtszahlen von Peptiden zu berechnen, da die Berechnungen ansonsten kompliziert sein können. Es gibt nicht nur eine Vielzahl von Molekulargewichten chemischer Elemente, die in Aminosäuresequenzen, aus denen Peptide bestehen, berücksichtigt werden müssen, sondern es müssen auch andere Faktoren berücksichtigt werden. Dabei kommen sowohl hydrophobe als auch hydrophile Eigenschaften gegenüber Wasser ins Spiel, sowie molare Absorptionskoeffizienten für die Proteine selbst. Die Avogadro-Zahl, die angibt, wie viele Moleküle in einem Mol vorhanden sind, muss auch verwendet werden, um das Volumen eines Peptids aus dem Molekulargewicht des Peptids zu bestimmen.
Aminosäuren sind die Bausteine für Peptide. Sie reichen von einem Restmolekulargewicht, das dem tatsächlichen Gewicht abzüglich Wasser entspricht, von 57.05 für das kleinste Molekül, Glycin, bis zu 156.19 für das größte Molekül, Arginin. Wenn zwei oder mehr Aminosäuren kombiniert werden, wird häufig ein Peptid-Molekulargewichtsrechner verwendet, um das neue Molekulargewicht zu bestimmen.
Die Bestimmung eines genauen Peptid-Molekulargewichts hat wichtige Anwendungen in einer Vielzahl von Forschungen. Beweise zeigen beispielsweise, dass niedermolekulare Peptide wichtige Regulatoren in der Biologie sind. Hormone, die diese Peptide enthalten, sind in Körperregionen wie dem Gehirn, dem Nervensystem und dem Magen-Darm-Trakt aktiv.