Die Ursachen der Legasthenie sind noch nicht vollständig geklärt, werden aber als weitgehend erblich angesehen. Andere Ursachen für Legasthenie können Hörstörungen in der frühen Kindheit sein, die dazu führen können, dass sehr kleine Kinder die richtigen Laute von Wörtern und Buchstaben missverstehen. Einige Experten glauben, dass Legasthenie aufgrund von Unterschieden in der Struktur oder Funktion des Gehirns auftritt. Die Gehirne von Menschen mit Legasthenie versuchen möglicherweise, gesprochene und geschriebene Sprache auf der rechten Seite des Gehirns zu verarbeiten, während die Gehirne von Menschen ohne Legasthenie versuchen, Sprache auf der linken Seite zu verarbeiten. Andere glauben, dass Legasthenie auftritt, wenn sich das Gehirn als Ganzes einfach nicht richtig bildet, oder dass eine Kombination all dieser Faktoren für Legasthenie verantwortlich sein könnte.
Einige Experten glauben, dass Hörstörungen bei sehr kleinen Kindern zu Legasthenie führen können. Das Argument für diese Theorie ist, dass diese kleinen Kinder diese Laute der Sprache falsch verstehen und falsch interpretieren und möglicherweise Schwierigkeiten haben, Buchstaben mit ihren richtigen Lauten zuzuordnen.
Andere glauben, dass Probleme mit der Entwicklung oder Funktion des Gehirns zu den Hauptursachen für Legasthenie gehören. Manche Forscher meinen, dass sich die Gehirne von Menschen mit Legasthenie einfach nicht richtig bilden, so dass die für das normale Sprachverständnis notwendigen neuronalen Verbindungen nicht gebildet werden. Wieder andere meinen, dass die Gehirne von Menschen mit Legasthenie versuchen, Sprache auf der rechten Gehirnhälfte zu interpretieren. Es wird angenommen, dass das Gehirn normaler Menschen Sprache auf der linken Seite des Gehirns interpretiert, so dass eine Person, die ihre rechte Gehirnhälfte verwendet, um Sprache zu interpretieren, einen erheblichen Nachteil haben kann.
Es wird angenommen, dass Vererbung eine der Hauptursachen für Legasthenie ist. Forscher glauben, dass eine Kombination von Genen an der Entstehung dieser Erkrankung beteiligt sein könnte. Es wurde ferner festgestellt, dass die eineiigen Zwillinge von Menschen mit dieser Erkrankung normalerweise auch sehr wahrscheinlich darunter leiden. Menschen mit Legasthenie haben normalerweise sehr wahrscheinlich einen Elternteil, Großelternteil, Tante, Onkel oder Geschwister mit der Behinderung. Viele Forscher räumen jedoch ein, dass die Ursachen der Legasthenie mysteriös bleiben und dass einige oder alle dieser Faktoren sowie noch nicht identifizierte Faktoren für die Erkrankung verantwortlich sein können.