Hay muchas posiciones básicas de las manos de reiki y muchas posiciones también tienen variaciones. Estas posiciones básicas de las manos de reiki se utilizan en la cara y la cabeza, en la parte delantera del cuerpo, en las rodillas y los pies, y luego en la espalda. Cada posición se mantiene durante varios minutos, o hasta que el practicante sienta que es hora de pasar a la siguiente.
Al realizar un tratamiento de reiki completo, los practicantes a menudo comienzan por detrás del cliente y comenzando por la cabeza. El paciente se coloca boca arriba, generalmente sobre una mesa. En la primera posición de la mano de reiki, el practicante coloca ligeramente las manos en la frente del cliente y coloca cuidadosamente una mano sobre cada ojo.
Para la posición de la segunda mano de reiki, el practicante coloca una mano a cada lado de la cabeza del paciente, cubriendo suavemente las sienes y las orejas. En la tercera posición de reiki, el practicante coloca ambas manos debajo de la cabeza para que las yemas de los dedos descansen en el pliegue donde la cabeza se une al cuello. Luego, el experto retrocede con mucha suavidad y lo sostiene. Esta es la posición de las manos de reiki más relajante para el receptor y ayuda a aliviar la tensión en el cuello.
El practicante mueve las manos para rodear la mandíbula y el cuello del paciente en la cuarta posición de las manos de reiki de modo que las puntas de los dedos toquen debajo de la barbilla. Para la posición de la quinta mano, el especialista en reiki coloca ligeramente una mano en el cuello debajo de la barbilla y coloca la otra mano en el medio del pecho entre los senos. En la sexta posición, el practicante se mueve hacia un lado del receptor y coloca ambas manos a través del área del plexo solar. Para la séptima posición, las manos se mueven hacia abajo por debajo del ombligo y se colocan sobre el abdomen. Luego, las manos se mueven hacia abajo para formar ligeramente una «V» sobre el área genital para la octava posición de las manos de reiki.
Después de enviar reiki a la cabeza y al torso, el experto en reiki baja hasta las rodillas del paciente. Se coloca una mano en la parte superior de una rodilla y la otra mano se coloca detrás de la rodilla. Una vez que termine la rodilla, el practicante repite las mismas posiciones de la mano de reiki en la otra rodilla antes de pasar a los pies. Cada tobillo, a su vez, se sujeta entre ambas manos y luego se coloca una palma contra la planta de cada pie. Luego se le pide al receptor que se dé la vuelta sobre su estómago para que el tratamiento de reiki pueda continuar en la espalda.
Cuando el paciente se haya dado la vuelta, el médico tomará una de las manos del receptor. Luego, el especialista colocará su otra mano en la parte superior de la columna. Después de esperar un intervalo adecuado, el practicante usará esa mano para «caminar» por la espalda del cliente, deteniéndose en cada punto para enviar energía de reiki a la columna. El tratamiento terminará después de que el médico forme una «T» con ambas manos justo por encima de las nalgas del cliente.