Die Atomenergiekommission wurde vom Kongress der Vereinigten Staaten gegründet, als er 1946 das Atomenergiegesetz erließ. Nach dem Zweiten Weltkrieg übertrug dieses Gesetz die Kontrolle und Aufsicht über die Atomenergie in den USA von den Militärdiensten auf die Atomic Energy Commission, eine zivile Behörde innerhalb der Bundesregierung. Im Allgemeinen hatte die Kommission vor ihrer Abschaffung die Aufgabe, die Erforschung, Entwicklung und Produktion von Atomwaffen sowie die friedliche Nutzung der Atomenergie zu lenken.
Zu den Aufgaben der Kommission gehörten die militärischen Ziele der Herstellung von Atombrennstoffen sowie die Erprobung und Herstellung von Kernwaffen. Es war auch für die Entwicklung von Kernreaktoren für zivile und militärische Zwecke verantwortlich. Schließlich sollte die Atomenergiekommission die Forschung zur Verwendung nuklearer Materialien in den Ingenieurwissenschaften sowie in den physikalischen, medizinischen und biologischen Wissenschaften leiten.
Administrativ wurde ein aus fünf Mitgliedern bestehendes Gremium an die Spitze der neuen Agentur berufen. Drei große beratende Ausschüsse wurden ebenfalls eingerichtet, um Input und Richtung zu geben. Die Atomenergiekommission war verpflichtet, sich mit dem Militärischen Verbindungsausschuss über alles zu beraten, was die militärische Anwendung der Atomenergie betraf. In den ersten 10 Jahren ihres Bestehens floss der Großteil der Ressourcen der Kommission in die Entwicklung und Produktion von Atomwaffen und anderen militärischen Nutzungen der Atomenergie. Ein gemeinsamer Ausschuss des Kongresses für Atomenergie sorgte für die Aufsicht des Kongresses, und der Allgemeine Beratungsausschuss, bestehend aus führenden Atomforschern, gab der Atomenergiekommission die erforderliche technische und wissenschaftliche Leitung.
Im Jahr 1954 erweiterte der US-Kongress die Aufgaben der Kommission durch die Änderung des ursprünglichen Atomenergiegesetzes von 1946. Die Änderungen von 1954 erlaubten der Kommission, Informationen über die Nukleartechnik an andere Länder sowie an private Unternehmen weiterzugeben. Dabei wurde die Atomic Energy Commission für die Überwachung der Ausweitung der geschäftlichen Nutzung von Kernenergie in den USA verantwortlich. In den 1960er und frühen 1970er Jahren arbeitete die Atomic Energy Commission mit Unternehmen der Privatindustrie zusammen, um Reaktoren zu entwickeln, die elektrische Energie erzeugen konnten. Darüber hinaus wurde der Atomenergiekommission 1954 die Aufgabe übertragen, die Sicherheit der Kernenergieindustrie zu regulieren.
Schließlich entwickelten sich Konflikte zwischen den Zuständigkeiten der Kommission für die Entwicklung und Regulierung der kommerziellen Kernenergieindustrie. Diese Konflikte führten 1974 dazu, dass der US-Kongress die Atomenergiekommission abschaffte. Ihre Zuständigkeiten wurden dann zwischen der neu geschaffenen Nuklearaufsichtskommission und dem Energieministerium aufgeteilt.