In einer Colon-Hydro-Klinik führen ausgebildete Fachkräfte wie Heilpraktiker Verfahren durch, bei denen der Dickdarm wiederholt mit Flüssigkeit gefüllt und entleert wird, um im Dickdarm angesammeltes Material auszuspülen. Dazu wird ein Schlauch in das Rektum eingeführt. Das Röhrchen liefert Flüssigkeit in den Dickdarm. Wenn sich der Dickdarm mit Flüssigkeit füllt, kann der behandelnde Therapeut den Bauch des Klienten massieren, um den Reinigungsprozess zu unterstützen. Die Flüssigkeit, die zur Reinigung des Dickdarms verwendet wird, wird normalerweise in Temperatur und Druck durch eine Maschine reguliert, die es dem Patienten ermöglicht, auch das Material zu sehen, das aus seinem Dickdarm austritt.
Um den Prozess so angenehm wie möglich zu gestalten, stellt eine Colon-Hydro-Therapie-Klinik dem Kunden normalerweise einen bequemen gepolsterten Liegetisch zur Verfügung. Die Liege ähnelt normalerweise einer Massageliege. Um das Einführen der Sonde in den Enddarm so angenehm wie möglich zu gestalten, hält die Klinik in der Regel auch natürliche oder synthetische Gleitmittel bereit, mit denen das Ende der Sonde beschichtet wird. Solche Gleitmittel können natives Kokosöl oder Gleitmittel umfassen, die ansonsten verwendet werden, um das sexuelle Vergnügen zu steigern.
Es ist üblich, dass eine Klinik für Colon-Hydro-Therapie einige Arten von Flüssigkeiten anbietet, die zur Reinigung des Dickdarms verwendet werden können. Die einfachste Flüssigkeit, die verwendet werden kann, ist gereinigtes Wasser. Manche Menschen entscheiden sich für Wasser, das mit Kräutern angereichert wurde, während andere Kaffee verwenden, um ihren Dickdarm zu reinigen. Eine Colon-Hydro-Therapie-Klinik kann auch eine Dickdarmbehandlung anbieten, bei der Wasser verwendet wird, das mit Knoblauch infundiert wurde. Kunden können auch die Temperatur und den Druck der Flüssigkeit während der Sitzung vom Therapeuten anpassen lassen, um die Erfahrung so angenehm wie möglich zu gestalten.
Obwohl Kunden die Kleidung der unteren Körperhälften abnehmen müssen, um sich einer Colon-Hydro-Therapie zu unterziehen, arbeitet eine Klinik für Colon-Hydro-Therapie normalerweise sehr hart daran, dass sich die Patienten so entspannt wie möglich fühlen. Vor der Hydrotherapie-Sitzung erhält der Klient den Therapieraum, um sich bei Bedarf auszuziehen und sich unter eine Decke, ein Laken oder ein Handtuch zu legen. Der Therapeut, der die Sitzung durchführt, kann normalerweise den größten Teil der Sitzung abschließen, ohne dass der Klient die privaten Bereiche der unteren Körperhälfte freilegen muss.