Ein weiblicher Bartagamen hat nur eine Eigenschaft, die ihn vom Aussehen her definitiv von einem männlichen Bartagamen unterscheiden kann. Das eindeutigste Merkmal eines weiblichen Bartagamen ist das Fehlen einer Hemipenalwölbung, während der männliche Bartagamen zwei Hemipenalwülste hat. Dieses Geschlechtsmerkmal ist jedoch normalerweise bei schlüpfenden Drachen und jungen Jungdrachen nicht sichtbar, obwohl es bei erwachsenen Bartagamen einfacher wird, das Geschlecht zu bestimmen.
Die Hemipenalwülste befinden sich unter dem Schwanz des Bartagamenmännchens über der ventralen Öffnung. Bei Männern sind Hemipenalwülste auf beiden Seiten des Schwanzes sichtbar. Dem Weibchen fehlen Hemipene, aber es wird eine leichte Wölbung in der Mitte ihres Schwanzes über der ventralen Öffnung geben. Obwohl dies das einzige Merkmal ist, anhand dessen das Geschlecht eines Bartagamen mit Sicherheit bestimmt werden kann, gibt es andere allgemeine Merkmale, die bei Männchen häufiger vorkommen als bei Weibchen und umgekehrt.
Eine der Eigenschaften von Bartagamen ist ihre Fähigkeit, ihre Bärte aufzublähen und ihre Bärte dunkel zu machen. Weibchen können dies ebenso wie Männchen, aber Männchen zeigen dieses Verhalten im Allgemeinen häufiger als Weibchen, und die Bärte der Männchen werden normalerweise dunkler als die Bärte weiblicher Drachen. Der Drache bläht seinen Bart auf und verdunkelt ihn als Teil der Balzroutine, wenn der bärtige Drache das Bedürfnis verspürt, sein Territorium zu verteidigen oder wenn der bärtige Drache sich bedroht fühlt.
Die Größe von Bartagamen ist kein geschlechtsspezifisches Merkmal, obwohl der weibliche Bartagamen im Allgemeinen einen kleineren Kopf hat als ihre männlichen Gegenstücke. Männchen haben oft dickere Schwänze als Weibchen, obwohl dies nicht zur Bestimmung des Geschlechts verwendet werden kann. Der Schwanz eines bärtigen Drachens wird mit zunehmendem Alter dicker, so dass ein älterer weiblicher bärtiger Drache eine dickere Geschichte haben könnte als ein jüngerer männlicher bärtiger Drache.
In vielen Fällen zeigen weibliche Bartagamen ein weniger aggressives Verhalten als männliche Bartagamen, aber wie bei anderen Eigenschaften ist dies nicht immer der Fall. Bartagamen erreichen die Geschlechtsreife bereits im Alter von acht Monaten. Weibliche Bartagamen graben und versuchen, Höhlen zu schaffen, in denen sie ihre Eier ablegen können. Selbst wenn sich ein weiblicher Bartagamen nicht paart, kann er dennoch Eier legen, mit etwa 20 Eiern in einem Gelege. Ein männlicher Bartagamen kann jedoch auch beim Graben von Höhlen gesehen werden, da einige Bartagamen auch Höhlen zum Schlafen und in Stresszeiten graben.