Un taxonomista tradicional es un biólogo que clasifica los organismos de acuerdo con sus características físicas o celulares. Estos científicos también intentan determinar las relaciones evolutivas entre estos organismos. Cuando se descubre un nuevo organismo, ya sea una planta, un animal o un microorganismo, un taxonomista le dará una designación linneana. Es decir, lo colocará en las categorías apropiadas dentro de los niveles taxonómicos de reino, filo, clase, orden, familia, género y especie. Cuando las personas se refieren al nombre científico de un organismo, como el conocido nombre de perro, Canis familiaris, están utilizando las designaciones de género y especie para ese organismo.
La clasificación taxonómica se ha logrado de muchas maneras diferentes a lo largo de los años. En los primeros días de la taxonomía formal, la biotecnología era muy limitada y los científicos tenían que clasificar los organismos basándose únicamente en características físicas observables. Con el desarrollo de la teoría evolutiva a mediados del siglo XIX, los taxonomistas comenzaron a clasificar los organismos en grupos representados por las ramas de un árbol evolutivo. Las especies que residen en ramas cercanas entre sí se considerarían estrechamente relacionadas en el sentido evolutivo, mientras que las especies que residen en ramas muy alejadas entre sí solo estarían relacionadas de forma distante.
Las relaciones indicadas por las posiciones de los organismos en el árbol evolutivo se denominan relaciones filogenéticas. Ahora que los científicos tienen la capacidad de secuenciar el ácido desoxirribonucleico (ADN) dentro de las células de los organismos, se pueden determinar con mayor precisión las relaciones filogenéticas. Esta técnica de análisis ha dado como resultado árboles evolutivos más precisos que los desarrollados por taxonomistas que se dedican solo a la anatomía. Los científicos también usan las técnicas de embriología, serología e inmunología para definir y refinar aún más las relaciones filogenéticas.
Para convertirse en taxonomista, uno debe obtener un título de cuatro años en un campo de biología, generalmente microbiología, zoología o botánica. El campo específico elegido dependería del tipo de taxonomista en el que el estudiante desee convertirse porque los taxonomistas tienden a especializarse dentro de ciertos reinos. Es decir, ningún taxonomista clasificará nuevas especies en todos los reinos de organismos. El estudiante, por ejemplo, se convertiría en un taxonomista de plantas o un taxonomista de animales. A menudo se requieren estudios de posgrado en metodologías de clasificación para que alguien se convierta en un taxonomista practicante y respetado.
En los últimos años, el término taxonomía se ha aplicado a profesiones más allá de la del sistematista biológico. Uno puede escuchar sobre taxonomistas militares o económicos. Estas son simplemente personas que clasifican aspectos de las fuerzas armadas o de la economía de manera muy similar a como los taxonomistas biológicos clasifican los organismos.