Quels sont les diff?rents types de workflows scientifiques ?

Les workflows scientifiques sont utilis?s pour am?liorer la mani?re dont la recherche est effectu?e. Les types les plus courants se concentrent sur les flux de travail de laboratoire, les flux de travail de calcul et les flux de travail d’analyse de donn?es. De nombreuses institutions d?veloppent des workflows scientifiques pour r?duire les erreurs, am?liorer les r?sultats et acc?l?rer la d?couverte. Les flux de travail sont souvent con?us sur mesure pour fonctionner pour des ?tudes sp?cifiques et peuvent varier selon l’industrie et le type de donn?es qui doivent ?tre collect?es et analys?es.

Les flux de travail scientifiques pour le laboratoire peuvent couvrir plusieurs aspects des op?rations. Dans de nombreuses institutions, il existe des flux de travail sp?cifiques pour pr?parer un ?chantillon ? tester. Par exemple, une clinique hospitali?re peut avoir des proc?dures bien d?finies pour acqu?rir un ?chantillon de patient, enregistrer cet ?chantillon, le suivre avec un scanner et un code-barres, le stocker et le pr?parer pour l’examen. Dans ce cas, le flux de travail scientifique pourrait ?tre une combinaison de proc?dures ?crites ? suivre et d’un logiciel informatique qui suit l’?chantillon de la collecte ? l’examen. Les informations sur l’?tat d’un ?chantillon sont souvent mises ? disposition via un portail Web pour un acc?s facile. Les op?rations de laboratoire utilisent ?galement des flux de travail pour garantir que les mat?riaux n?cessaires sont disponibles, tels que les r?actifs chimiques n?cessaires pour effectuer un test, sont en stock et disponibles lors de l’ex?cution d’une exp?rience.

Une autre forme de flux de travail scientifique pour le laboratoire concerne la r?alisation de l’exp?rience proprement dite. Par exemple, un chercheur peut vouloir photographier une certaine r?gion du ciel ou s?quencer l’ADN d’une cellule particuli?re. Dans les deux cas, un flux de travail dicterait les ?tapes qu’un chercheur suivrait pour terminer l’observation. Par exemple, les astronomes devraient obtenir les coordonn?es de la r?gion qu’ils souhaitent ?tudier, saisir ces donn?es dans le syst?me de suivi du t?lescope et positionner une cam?ra num?rique pour capturer une image. De tels flux de travail pourraient ?tre utilis?s par une institution pour planifier du temps sur un ?quipement sp?cial afin d’assurer ?galement une utilisation optimale de cet ?quipement.

Aujourd’hui, de nombreuses recherches se font par mod?lisation et simulation informatiques. Les flux de travail scientifiques pour ce type de recherche peuvent inclure des proc?dures de cr?ation du programme, de d?pannage, puis de soumission et d’ex?cution de ces travaux de calcul. Dans de nombreux laboratoires, un chercheur peut soumettre un travail en ligne ? un centre informatique. Les t?ches sont ensuite automatiquement planifi?es en fonction de divers facteurs, notamment le niveau de priorit?, les ressources disponibles et la dur?e d’ex?cution de la t?che. Dans la plupart des cas, les informations sur l’?tat du travail sont disponibles en ligne, de sorte que ceux qui ont soumis un travail peuvent rapidement v?rifier son ?tat pour voir s’il est programm? pour s’ex?cuter, s’ex?cuter ou se terminer.

Une fois qu’une exp?rience est r?alis?e, qu’un test en laboratoire est termin? ou qu’une simulation informatique est effectu?e, il est souvent n?cessaire d’avoir un autre type de flux de travail scientifique pour analyser les donn?es collect?es. Souvent, la premi?re ?tape d’un tel workflow d’analyse scientifique consiste ? extraire les donn?es d’une base de donn?es, d’un fichier ou d’un site Web sp?cifique. Les donn?es doivent ensuite ?tre mises dans un format appropri?. Cela peut ?tre quelque chose d’aussi simple que de convertir une lecture de temp?rature en degr?s Fahrenheit en degr?s Celsius ou une mesure de distance de pieds en miles. Les donn?es sont ensuite soumises ? une routine d’analyse et peuvent devoir ?tre compar?es ? d’autres donn?es. Les r?sultats finaux sont ensuite pr?sent?s au chercheur, g?n?ralement sous la forme d’un rapport, d’un dossier ou d’un affichage visuel.

Dans tous ces types de flux de travail scientifiques, l’avantage est que les chercheurs ont des m?thodes normalis?es pour effectuer leur travail. Dans certains cas, l’automatisation peut ?tre appliqu?e ? certaines ?tapes d’un flux de travail. L’automatisation aide ? d?charger le travail du chercheur et ? acc?l?rer le processus.

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