Das sechste Chakra, das im Sanskrit als Ajna bekannt ist, wird oft als das dritte-Auge-Chakra bezeichnet und soll sich auf der Stirn direkt über der Nase befinden. Laut Menschen, die Kundalini und andere Yogaformen praktizieren, ist dieses Chakra das Körperzentrum für spirituelle Energien, die sich auf genaue Wahrnehmung, Verständnis und geistige Schärfe beziehen. Die Energien des sechsten Chakras sollen Einfluss auf die Augen, das Gehirn, die Zirbeldrüse und die Hypophyse haben. Es wird angenommen, dass Ungleichgewichte oder Blockaden in diesem Chakra zu Migräne, Sehverlust, unangenehmen Träumen und Augenermüdung führen. Praktizierende der yogischen Künste glauben, dass positives Denken, das Singen von Mantras und das Ausführen von umgekehrten und balancierten Yoga-Posen Blockaden aus dem sechsten Chakra lösen und seine Energien ausgleichen können.
Die Energien des sechsten Chakras sollen einen starken Einfluss auf den Geist und damit auch auf das endokrine System haben. Yoga-Praktizierende glauben oft, dass Geist und Körper intrinsisch miteinander verbunden sind, so dass der mentale Zustand die Macht haben kann, den physischen Zustand zu beeinflussen. Nach diesen Überzeugungen kann sich jemand, der positive Gedanken und einen ruhigen, kontrollierten Geist kultiviert, eher einer guten körperlichen Gesundheit erfreuen.
Das Dritte-Auge-Chakra wird für die Fähigkeit verantwortlich gemacht, die Realität wahrzunehmen und zu verstehen. Es wird angenommen, dass Störungen im Chakra des dritten Auges Störungen der Wahrnehmung und eine Trennung von der Realität verursachen. Es wird angenommen, dass negative Gedanken und Emotionen wie Angst aus Störungen im Energiehaushalt des sechsten Chakras resultieren.
Viele Yogapraktizierende glauben, dass eine angemessene Haltung entscheidend ist, um das sechste Chakra zu reinigen und seine Energien auszugleichen. Es wird angenommen, dass eine unangemessene Haltung, in der der Kopf nach vorne ragt, zur Blockade des dritten Auges-Chakras beiträgt. Die Kultivierung positiver Gedanken und Überzeugungen soll auch für das reibungslose Funktionieren des dritten-Auge-Chakras sehr vorteilhaft sein. Affirmationen und Mantras, die den Wurzelklang „om“ verwenden, sollen nützlich sein, um die Energien des dritten Auges zu fokussieren.
Menschen, die Hatha-Yoga praktizieren, glauben in der Regel, dass balancierte Yoga-Posen dem Chakra des dritten Auges zugute kommen können. Posen wie die Pose des Tänzers sollen helfen, den Geist zu beruhigen und zu fokussieren. Es wird auch angenommen, dass umgekehrte Posen, wie der Schulterstand, den Geist beruhigen und dem Chakra des dritten Auges zugute kommen.