Die Geschichte des Staatssiegels von Mississippi reicht bis ins 18. Jahrhundert zurück. Das Bild, das das offizielle Siegel werden sollte, wurde erstmals 1798 ausgewählt, als es als Siegel des Mississippi-Territoriums angenommen wurde. Das Territorialsiegel wurde offiziell zum Staatssiegel von Mississippi, als Mississippi 1817 die Eigenstaatlichkeit erlangte und hat seit dieser Zeit das gleiche Design beibehalten. Die Bildsprache des Siegels ist noch älter und wurde wahrscheinlich von Quellen beeinflusst, die Jahrhunderte vor der Existenz des Bundesstaates Mississippi und der Vereinigten Staaten von Amerika selbst liegen.
Das Staatssiegel von Mississippi zeigt einen goldenen Weißkopfseeadler auf weißem Grund. Der Adler hält Pfeile in einer seiner Krallen und einen Olivenzweig in der anderen, die Krieg und Frieden symbolisieren. Auf der Brust des Adlers befindet sich ein Schild mit einer Gruppe weißer Sterne auf blauem Feld im oberen Bereich des Schildes und einer Reihe vertikaler rot-weißer Streifen darunter. Der Adler ist von einem blauen Kreis umgeben, um den die Worte „The Great Seal of the State of Mississippi“ in goldenen Buchstaben gewickelt und von einem zweiten, größeren blauen Kreis umgeben sind.
Die Geschichte des Siegels reicht über den heutigen Bundesstaat Mississippi hinaus. Zum Zeitpunkt der ursprünglichen Annahme des Siegels als Siegel des Mississippi-Territoriums umfassten die Grenzen dieses Territoriums nicht nur den modernen Bundesstaat Mississippi, sondern auch Alabama. Als Mississippi 1817 ein Staat wurde, wurde das Territorialsiegel vom neu gegründeten Staat Mississippi angenommen, während der Rest des ehemaligen Mississippi-Territoriums vom Kongress als Alabama-Territorium umbenannt wurde, bis der Bundesstaat Alabama in die Union aufgenommen wurde im Jahr 1819.
Das Hauptmerkmal des Bildes, der Weißkopfseeadler, der Pfeile und einen Olivenzweig in seinen Krallen hält und einen rot-weiß-blauen Schild auf der Brust trägt, basiert auf dem ähnlichen Adler, der auf dem Großen Siegel der Vereinigten Staaten abgebildet ist. Das US-Siegel, in dem der Adler einen Olivenzweig und 13 Pfeile hält, um die ursprünglichen 13 Staaten zu repräsentieren, wurde 1782 vom Kongress angenommen, nachdem eine Reihe von Ausschüssen sechs Jahre lang verschiedene Designs geprüft hatten. Weißkopfseeadler, die Pfeile umklammern, erscheinen auch auf den Siegeln der Bundesstaaten New Mexico und Utah, und die Siegel von Illinois und Pennsylvania zeigen auch einen Adler, der einen Schild trägt.
Das Bild eines Adlers, der einen Schild trägt, oder eines Adlers oder eines anderen Tieres, das eine Gruppe von Pfeilen oder einen Olivenzweig hält oder sich in der Nähe befindet, geht noch weiter zurück. Ein Adler, der einen Schild trägt, erscheint in einigen Heraldiken und Münzen aus Kontinentaleuropa, obwohl die Verwendung eines Weißkopfseeadlers, einer in Nordamerika beheimateten Art, eine Innovation war. Das Wappen der Republik der Sieben Vereinigten Niederlande, allgemein einfach als Niederländische Republik bekannt, zeigte einen Löwen, der ein Schwert in seiner rechten Vorderpfote und sieben Pfeile hielt, einen für jede der sieben Provinzen. Die niederländische Republik war das weltweit führende Beispiel für eine republikanische Regierung, die zum Zeitpunkt der Annahme des US-Siegels durch eine Konföderation einzelner Staaten gebildet wurde, und die niederländische Verfassung beeinflusste das politische Denken vieler Gründer Amerikas. So könnte dieses Bild auch eine Inspiration für das Große Siegel der Vereinigten Staaten und folglich das Staatssiegel von Mississippi gewesen sein.