La conexión entre el cerebro medio y la protuberancia es que ambos son parte del tronco encefálico. Físicamente, el mesencéfalo y las protuberancias están justo encima y debajo uno del otro. El mesencéfalo se encuentra en la parte superior del tronco encefálico y la protuberancia se asienta directamente debajo del mesencéfalo. Sin embargo, la diferencia entre el mesencéfalo y la protuberancia es que realizan diferentes funciones. Además, aunque el mesencéfalo y la protuberancia son partes separadas del tronco encefálico, la protuberancia también es parte del cerebro posterior.
En general, la función general del tronco encefálico es facilitar y permitir la comunicación entre el cerebro y la médula espinal, que constituyen el sistema nervioso central. El mesencéfalo, que también se conoce como mesencéfalo, se encuentra entre el prosencéfalo y la protuberancia. Como parte del tronco encefálico, el cerebro medio tiene la responsabilidad de ayudar a coordinar los mensajes entre el cerebro y la médula espinal. Además de esta función, el mesencéfalo también es responsable de algunos reflejos, así como de algunos movimientos voluntarios. Por ejemplo, el cerebro medio coordina los reflejos oculares. También ayuda a coordinar la postura, así como caminar.
La protuberancia, o metencefalón, se encuentra entre el mesencéfalo y la médula, otra parte del cerebro posterior que también forma el resto del tronco encefálico. Además, la protuberancia conecta la médula con el cerebelo. Al igual que el mesencéfalo, el pons ayuda a coordinar la transferencia de mensajes dentro del cerebro, actuando como un puente para la comunicación entre el cerebro, la médula espinal y el cerebelo. El pons también es responsable de otras funciones, como ayudar a regular la respiración y comenzar o terminar los impulsos motores y la información sensorial que se envía hacia y desde el cerebro y la cara.
El sistema nervioso central está formado básicamente por el cerebro y la médula espinal. El cerebro envía mensajes motores a la médula espinal, que luego los envía a la parte adecuada del cuerpo. La médula espinal, a su vez, envía mensajes sensoriales al cerebro. Esta comunicación permite que el cuerpo humano funcione como lo hace, y como el tronco encefálico juega un papel vital en esta comunicación, sin el tronco encefálico, se perdería el intercambio de información entre el cerebro y el cuerpo. Como tal, está claro que el mesencéfalo y la protuberancia son dos partes pequeñas, pero muy importantes, del sistema nervioso central.