A malária endêmica é a malária que permanece natural e consistentemente presente em uma região porque há muitos vetores da doença, garantindo que ela continue a ser transmitida pela sociedade. Os países onde a malária é endêmica estão localizados principalmente nos trópicos e tendem a ser nações em desenvolvimento com infraestrutura de saúde pública limitada para combater a doença. O combate à malária em todo o mundo incluiu um foco no tratamento da malária endêmica com o objetivo de erradicá-la dessas regiões para eliminar os reservatórios naturais da doença.
A malária se torna endêmica para várias regiões. Este parasita requer mosquitos de espécies específicas como parte de seu ciclo de vida e, portanto, não pode se tornar endêmico em regiões onde essas espécies não são suportadas. Os trópicos tendem a ser muito hospitaleiros para os mosquitos por causa do calor e do amplo suprimento de água estagnada. Em regiões onde o controle do mosquito é limitado, pode ser difícil evitar que os insetos infectados piquem os humanos e transmitam a infecção.
Se a população humana usa a profilaxia da malária, essas picadas não são um problema, pois os parasitas não conseguem sobreviver em seus corpos. O uso inconsistente ou inexistente de profilaxia, no entanto, cria um caminho para que as infecções por malária se instalem, e os pacientes infectados aumentam o ciclo de vida do parasita, com os mosquitos se alimentando deles e pegando sangue infectado, perpetuando a doença. As pessoas também viajam, trazendo o parasita com elas à medida que avançam e criando um suprimento infinito de novos vetores.
Os esforços para controlar a malária endêmica incluem tentativas de limitar as populações de mosquitos e o contato entre insetos e humanos, como o uso de pesticidas, rastreio de casas e camas para evitar que os insetos entrem e dosagem de compostos conhecidos por causar infertilidade em mosquitos, evitando assim o insetos de reprodução. O fornecimento de profilaxia e tratamento contra a malária a preços acessíveis é outra medida para resolver este problema. Os viajantes para regiões com malária endêmica geralmente são aconselhados a tomar medicamentos profiláticos para não transportarem o vírus para casa.
Em nações onde a infraestrutura de saúde pública é irregular e mal suportada, a malária endêmica é difícil de combater. Pode haver regiões onde as pessoas têm o vírus sob controle, mas em outras ele pode ser generalizado e muito comum. Conforme as pessoas viajam entre as regiões, elas trazem o parasita para frente e para trás com elas, criando novos surtos de doenças. Políticas consistentes e até mesmo de controle da malária também têm que cruzar fronteiras, já que um programa rigoroso em uma nação não adianta muito se o país vizinho tiver um programa ineficaz de controle da malária em vigor.