L’idea di una pietra filosofale è comune nella mitologia europea. JK Rowling ha preso in prestito l’idea di una pietra creata alchemicamente con proprietà magiche per la sua popolare serie di Harry Potter. Nei libri di Harry Potter c’è solo una Pietra Filosofale, creata da Nicolas Flamel nel 1400. La pietra di Flamel è in grado di trasformare gli oggetti in oro e produrre un elisir di lunga vita che garantisce l’immortalità al bevitore.
L’oggetto magico è apparso per la prima volta in Harry Potter e la pietra filosofale, pubblicato negli Stati Uniti con il titolo Harry Potter e la pietra filosofale. Scholastic, l’editore americano dei libri di Harry Potter, credeva che i lettori americani non sarebbero stati così attratti da un libro sulla “Pietra filosofale”. Questa scelta è stata criticata, insieme all’americanizzazione dei libri di Harry Potter usciti negli Stati Uniti: sono state apportate piccole modifiche alla lingua usata dai personaggi per paura che gli americani non la capissero.
La Pietra Filosofale è un elemento cruciale del libro. Nicolas Flamel è un amico di Albus Silente, Preside della Scuola di Magia e Stregoneria di Hogwarts. I due hanno lavorato insieme a progetti di alchimia, presumibilmente lavorando con la stessa Pietra Filosofale per esplorarne le proprietà. Flamel si rivolge anche a Silente per tenere al sicuro la pietra, e nella prima parte del libro, viene spostata dal Vault 713 della Gringott a Hogwarts, dove si presume sia più al sicuro.
Cooperando con diversi istruttori della scuola, Silente pone una serie di ostacoli sulla via della Pietra Filosofale per proteggerla. La serie di protezioni incantate è progettata per impedire a Voldemort di ottenere la Pietra Filosofale, poiché Silente è preoccupato che Voldemort risorgerà. Alla fine, Voldemort è in grado di penetrare tutte le protezioni tranne l’ultima: Silente nasconde abilmente la pietra all’interno dello Specchio delle Brame in modo tale che solo chi vuole trovare la Pietra Filosofale ma non usarla può ottenerla.
In una lezione su obiettivi e motivazioni, Harry lo ottiene perché si guarda allo specchio senza intenzione di usarlo, e resiste anche con successo a un tentativo di Voldemort di prendere la Pietra Filosofale con la forza. Dopo questa scena culminante, la Pietra Filosofale viene distrutta per impedire a Voldemort di ottenerla, e Nicolas Flamel e sua moglie si preparano alla loro morte. Harry è inizialmente preoccupato per i due, ma Silente sottolinea che Flamel è vivo da oltre seicento anni, ed è probabilmente pronto a perseguire “la prossima grande avventura” della morte.