Qu’est-ce qu’un métabolome ?

Un métabolome est une décomposition détaillée des produits chimiques de signalisation, des métabolites, des hormones et des structures similaires trouvées dans un organisme. Certains d’entre eux sont produits naturellement, d’autres par le métabolisme de divers aliments et médicaments ingérés. Au cours de sa vie, la collection de composés chimiques d’un organisme changera. Il est possible de prendre un instantané dans le temps pour voir ce qu’un organisme contenait et produisait à un moment donné, mais cela changera d’instant en instant.

L’étude du métabolome humain est un sujet d’intérêt particulier. Les tests médicaux reposent souvent sur des métabolites à des fins de diagnostic. Un médecin peut vérifier la présence ou l’absence de composés pour exclure ou exclure les maladies, ou pour voir dans quelle mesure un patient réagit aux médicaments. Seule une fraction est identifiable avec des tests médicaux de base. L’augmentation du nombre de métabolites que les médecins pourraient tester créerait plus d’opportunités pour un diagnostic et des tests précis des patients.

Cela offre une occasion unique d’étudier les interactions entre la génétique et l’environnement. Le génome code pour la production d’un certain nombre de composés comme les hormones, les enzymes, etc. Les erreurs peuvent créer des problèmes tels que des carences ou des produits chimiques défectueux. Pendant ce temps, l’environnement a également un impact sur le métabolome d’une personne ; ce que la personne mange, boit et est autrement exposée changera son métabolome et créera un ensemble différent de produits chimiques de signature.

Les chercheurs qui s’intéressent à la façon dont l’environnement et la génétique peuvent interagir peuvent étudier le métabolome pour examiner l’intersection de ces sujets. Ils peuvent examiner la façon dont les influences environnementales font taire les gènes ou les activent, par exemple. Il peut également fournir des indices sur la façon dont les organismes réagissent aux changements de circonstances environnementales et sur ce qui se passe lorsque les organismes sont exposés à des toxines. Le métabolome contient une variété de produits chimiques que le corps utilise pour la vie, des molécules d’énergie aux cellules d’alimentation en passant par les hormones de signalisation qui déclenchent la fertilité et permettent la reproduction.

Une équipe de recherche canadienne a été la première à développer une séquence approximative du métabolome humain. Ce travail est difficile, car des échantillons provenant de différentes zones du corps contiendront différents produits chimiques, et ceux-ci peuvent également changer avec le temps. Le simple séquençage des composés trouvés dans les cellules du foie, par exemple, donnerait une image différente de l’étude des tissus et des fluides d’autres parties du corps, car de nombreuses parties du métabolome sont très spécifiques à l’emplacement. Certaines cellules de signalisation ne se trouvent que dans des régions spécifiques, tandis que des métabolites spécifiques peuvent se trouver dans certaines zones du corps, mais pas dans d’autres. Un séquençage réussi nécessite un échantillonnage détaillé et méticuleux.