L’acido ribonucleico (RNA) polimerasi II avvia il processo di trascrizione che copia il DNA legandosi a una parte di un gene. Una polimerasi è un enzima che funge da catalizzatore nella formazione di nuovo DNA e RNA da un filamento esistente di DNA o RNA. L’RNA polimerasi II (RNAP II) trascrive tutte le molecole di acido ribonucleico messaggero (mRNA) all’interno di una cellula. È anche noto come Poll II.
L’RNA polimerasi II avvia una reazione chimica. Funziona aprendo prima una sezione di una molecola di DNA. Quindi si srotola e separa la doppia elica del DNA, dividendola in due fili in un modo simile a decomprimere una cerniera. Quindi la polimerasi consente la trascrizione o la copia di tutte le molecole di mRNA all’interno di una cellula.
I nucleotidi possono essere paragonati ai denti di una cerniera. Con i due filamenti di DNA separati, un nuovo filamento di RNA inizia a formarsi quando l’RNA polimerasi II abbina nucleotidi complementari a un filamento del DNA, creando così un filamento di RNA che imita l’altro filamento di DNA. Il risultato può essere paragonato a una cerniera RNA-DNA. Il filamento di RNA appena formato viene quindi “decompresso” dal filamento di DNA ed esce dalla polimerasi. I filamenti di DNA si ricongiungono e la polimerasi continua a muoversi lungo la lunghezza del filamento di DNA, ripetendo questo processo.
Il processo è talvolta interrotto. I virus che alterano l’espressione genica spesso lo fanno bloccando il processo di trascrizione dell’RNA polimerasi II. Il virus dell’influenza, ad esempio, è stato trovato per inibire e distruggere questa particolare polimerasi in alcuni casi.
Uno dei diversi tipi di macromolecole, l’RNA polimerasi II è in realtà un grande complesso costituito da 10 diverse sottounità proteiche. Trascrive RNA messaggero e diversi piccoli RNA nucleari. Questo è solo uno dei numerosi tipi di polimerasi.
L’RNA polimerasi II differisce dall’RNA polimerasi III, la cui funzione è principalmente quella di regolare la crescita cellulare. Un’altra importante differenziazione è che le DNA polimerasi non possono iniziare un nuovo filamento, ma una RNA polimerasi può. Una proteina legante l’RNA (RBP) può essere un fattore chiave nel controllo e nella regolazione dell’RNA polimerasi II.
Più di un tipo di RNA viene tradotto usando una polimerasi. Messenger RNA (mRNA) è tradotto in un polipeptide. L’RNA polimerasi II viene utilizzato per trascrivere l’RNA di trasferimento (tRNA), che trasporta gli amminoacidi nel polipeptide in crescita. Viene anche usato per trascrivere l’RNA ribosomiale (rRNA), che viene utilizzato per costruire i ribosomi di una cellula.