Un promotore di RNA è una sequenza di nucleotidi che precede un gene che codifica per l’acido ribonucleico (RNA). Questa sequenza si trova nell’acido desossiribonucleico (DNA) di una cellula e, come tutti i promotori, un promotore di RNA aiuta a facilitare la trascrizione genica. La differenza tra questo tipo di promotore e altri tipi di promotori è che, mentre molti geni che seguono un promotore codificano l’RNA di memoria (mRNA), i geni che seguono un codice promotore di RNA per l’RNA ribosomiale (rRNA), utilizzati nei ribosomi per aiutare a tradurre l’mRNA in proteine. I promotori dell’RNA si trovano nelle informazioni genetiche di tutte le cellule eucariotiche, quindi sono presenti tutti gli organismi ad eccezione di batteri e virus. Questo promotore può essere riconosciuto dalle proteine ??che si legano sia alla sua sequenza nucleotidica sia all’enzima responsabile della trascrizione, accelerando la velocità con cui ha luogo la trascrizione.
Il promotore dell’RNA fornisce la sua funzione fornendo un sito di legame per l’RNA polimerasi I, l’enzima che trascrive l’RRNA, nonché i fattori di trascrizione associati. La sequenza del promotore sul DNA è diversa dalla maggior parte dei geni, che usano una serie di nucleotidi di timina e adenina chiamata scatola TATA. Il promotore di RNA, invece, ha una sequenza chiamata sequenza di controllo a monte (UCS) che viene riconosciuta da una proteina chiamata fattore di legame a monte (UBF). Dopo che sono stati legati, un complesso proteico più grande, chiamato fattore di inizio della trascrizione-IB (TIF-IB). TIF-IB è costituito dalla proteina di legame TATA (TBP) utilizzata in altri promotori, nonché da altri enzimi del fattore di trascrizione. Gli altri enzimi presenti aiutano il TBP a legarsi all’UBF, poiché, come menzionato sopra, non esiste una scatola TATA sulle sequenze di codifica di rRNA del DNA a cui legarsi.
Dopo che il complesso TIF-IB è legato a monte del codice genetico per l’rRNA, viene fosforilato, il che attiva il complesso e gli consente di reclutare e legare l’RNA polimerasi I. Questo è l’unico enzima in grado di trascrivere la codifica della sequenza di DNA per l’rRNA e, come tale, l’unico tipo di polimerasi che utilizza il promotore di RNA. Si lega a una parte del complesso promotore che consiste nel fattore IA associato alla proteina TBP e quindi, a sua volta, può legarsi alla sequenza di DNA a valle del complesso promotore che codifica per l’rRNA. Attraverso questo promotore, l’RNA polimerasi posso trovare le sequenze di DNA necessarie per trascrivere molto più rapidamente rispetto a se dovesse individuare queste sequenze da sole, quindi questo promotore è un mezzo per regolare il tasso di trascrizione dell’rRNA.