Die Verbindung zwischen Mittelhirn und Pons besteht darin, dass sie beide Teil des Hirnstamms sind. Körperlich liegen Mittelhirn und Pons direkt über- und untereinander. Das Mittelhirn sitzt an der obersten Spitze des Hirnstamms und der Pons sitzt direkt unter dem Mittelhirn. Der Unterschied zwischen Mittelhirn und Pons besteht jedoch darin, dass sie unterschiedliche Funktionen erfüllen. Obwohl das Mittelhirn und der Pons beide separate Teile des Hirnstamms sind, ist der Pons tatsächlich auch ein Teil des Hinterhirns.
Im Allgemeinen besteht die Gesamtfunktion des Hirnstamms darin, die Kommunikation zwischen dem Gehirn und dem Rückenmark, die das zentrale Nervensystem bilden, zu erleichtern und zu ermöglichen. Das Mittelhirn, auch Mesencephalon genannt, liegt zwischen Vorderhirn und Pons. Als Teil des Hirnstamms hat das Mittelhirn die Verantwortung, Nachrichten zwischen Gehirn und Rückenmark zu koordinieren. Neben dieser Funktion ist das Mittelhirn auch für einige Reflexe sowie einige willkürliche Bewegungen verantwortlich. Zum Beispiel koordiniert das Mittelhirn die Augenreflexe. Es hilft auch, die Körperhaltung sowie das Gehen zu koordinieren.
Das Pons oder Metencephalon befindet sich zwischen dem Mittelhirn und der Medulla, einem weiteren Teil des Hinterhirns, der auch den Rest des Hirnstamms ausmacht. Außerdem verbindet der Pons die Medulla mit dem Kleinhirn. Wie das Mittelhirn hilft das Pons bei der Koordination der Übertragung von Nachrichten innerhalb des Gehirns und fungiert als Brücke für die Kommunikation zwischen Großhirn, Rückenmark und Kleinhirn. Der Pons ist auch für andere Funktionen verantwortlich, wie zum Beispiel die Atmung zu regulieren und motorische Impulse und sensorische Informationen, die zum und vom Gehirn und Gesicht gesendet werden, zu beginnen oder zu beenden.
Das zentrale Nervensystem besteht im Wesentlichen aus dem Gehirn und dem Rückenmark. Das Gehirn sendet motorische Botschaften an das Rückenmark, das sie dann an den richtigen Teil des Körpers weiterleitet. Das Rückenmark sendet wiederum sensorische Botschaften an das Gehirn. Diese Kommunikation ermöglicht dem menschlichen Körper, so zu funktionieren, wie er es tut, und da der Hirnstamm eine entscheidende Rolle bei dieser Kommunikation spielt, würde ohne den Hirnstamm der Informationsaustausch zwischen Gehirn und Körper verloren gehen. Als solches ist klar, dass das Mittelhirn und der Pons zwei kleine, aber sehr wichtige Teile des zentralen Nervensystems sind.