Die Pflege von Meereskaiserfischen wird oft als schwierig angesehen und nur von erfahrenen Aquarienbesitzern versucht. Unter den richtigen Bedingungen können viele dieser Fische jedoch ziemlich robust sein und viele Jahre leben. Ihre schönen leuchtenden Farben können einen Blickfang in einem Riffaquarium bilden, was geeignet ist, da viele Kaiserfische sehr territorial sind und sich den Raum nicht so leicht mit anderen derselben Art teilen. Es ist auch wichtig, mit den spezifischen Eigenschaften der gekauften Kaiserfischart vertraut zu sein, da ihre Nahrungspräferenzen, ihre Größe und die Anforderungen an den Lebensraum erheblich variieren. Auch beim Einsetzen neuer Fische in ein Meerwasseraquarium sollte besonders auf die richtige Akklimatisierung geachtet werden.
Wie alle marinen Fischarten, deren natürlicher Lebensraum der Ozean ist, können Salzwasserkaiserfische nur in einem Riff- oder Salzwasseraquarium gehalten werden. Der Beginn eines neuen Aquariums für Meereskaiserfische beginnt mit der Verwendung der richtigen Wasserart. Das meiste Leitungswasser enthält Chlor und andere Chemikalien, die Fische in ausreichender Konzentration töten können, und verschiedene Fische reagieren mehr oder weniger empfindlich auf diese Substanzen. Es können Geräte und chemische Zusätze erworben werden, die schädliche Stoffe aus dem Wasser entfernen. Verschiedene Arten von Salzwasserkaiserfischen benötigen möglicherweise unterschiedliche Salzgehalte, Alkalinität oder Nährstoffgehalte im Wasser, um zu überleben.
Ein weiterer wichtiger Faktor bei der Pflege von Meereskaiserfischen ist die Wassertemperatur. Im Gegensatz zu vielen Süßwasserarten können viele Salzwasserfische plötzliche Schwankungen nicht überleben, und es muss darauf geachtet werden, dass die Wassertemperatur konstant bleibt. Salzwasseraquarien sollten über genaue Thermometer verfügen und sollten nicht in der Nähe von Fenstern, Heiz- und Kühlöffnungen oder anderen Bereichen des Hauses aufgestellt werden, in denen erhebliche Temperaturschwankungen wahrscheinlich sind. Wie beim Wassergehalt können Meereskaiserfische je nach natürlichem Lebensraum unterschiedliche Temperaturbedürfnisse haben.
Viele Fische werden als Jungfische verkauft, so dass ein unerfahrener Aquarienbesitzer möglicherweise nicht erkennt, dass ein Meereskaiserfisch viel Platz benötigt, wenn er eine ausgewachsene Größe erreicht, die manchmal mehr als 12 cm lang sein kann. Es wird oft vorgeschlagen, dass die Mindestgröße für ein Salzwasseraquarium 30.48 Gallonen beträgt, was eine erhebliche Investition sein kann, und dass Meeresfische oft mehr Platz benötigen als ihre Süßwasser-Pendants. Darüber hinaus sind einige Meereskaiserfische oft sehr territorial und können andere Bewohner des Aquariums beißen oder sogar töten. Daher ist es wichtig zu wissen, ob eine bestimmte Art alleine gehalten werden muss oder mit anderen Fischen koexistieren kann.